RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391058.1

RNU6-1177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DNAJB5O75953 348 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GPANK1O95872 356 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SRGNP10124 158 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PSG1P11464 419 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DRD4P21917 467 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TNFRSF8P28908 595 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ITGAEP38570 1179 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KCNJ5P48544 419 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HSD11B2P80365 405 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PTPRRQ15256 657 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TXNRD1Q16881 649 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GEN1Q17RS7 908 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FBXO33Q7Z6M2 555 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FAM169BQ8N8A8 192 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FBXO41Q8TF61 875 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 E2F7Q96AV8 911 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF428Q96B54 188 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 REPS1Q96D71 796 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF414Q96IQ9 312 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF479Q96JC4 524 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MAML3Q96JK9 1138 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FAM234AQ9H0X4 552 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SELENONQ9NZV5 590 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 USP25Q9UHP3 1055 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ICAM5Q9UMF0 924 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SNED1Q8TER0 1413 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 A0A0A6YYJ9 748 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 A0A1W2PQU0 124 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CCDC66A2RUB6 948 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FAM83GA6ND36 823 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SMIM22K7EJ46 135 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ACOT8O14734 319 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 JTBO76095 146 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NGFRP08138 427 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CHRM2P08172 466 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GJA8P48165 433 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 BCAR1P56945 870 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CFHR1Q03591 330 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CD69Q07108 199 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C10orf25Q5T742 122 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MED25Q71SY5 747 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PIP4P1Q86T03 277 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CAMKK1Q8N5S9 505 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C8orf58Q8NAV2 365 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C5orf34Q96MH7 638 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MLXIPQ9HAP2 919 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 POT1Q9NUX5 634 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SH3BP4Q9P0V3 963 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TRAF6Q9Y4K3 522 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 WDR17Q8IZU2 1322 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SCN5AQ14524 2016 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 WDR27A2RRH5 827 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 B2RBV5 119 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 VWC2LB2RUY7 222 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ARVCFO00192 962 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GSTA4O15217 222 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRODHO43272 600 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 OPHN1O60890 802 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 EFCAB14O75071 495 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 URI1O94763 535 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 BRD1O95696 1058 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LY86O95711 162 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TTLL1O95922 423 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LDLRP01130 860 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRG2P13727 222 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GCSHP23434 173 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FNTBP49356 437 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 VEGFCP49767 419 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DNM2P50570 870 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CCT8P50990 548 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GAS1P54826 345 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PDE4CQ08493 712 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MYBPC3Q14896 1274 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NFATC4Q14934 902 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FAM47CQ5HY64 1035 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TTC38Q5R3I4 469 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CEP85LQ5SZL2 805 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa0.59□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms