RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 PTK2BQ14289 1009 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CNPY1Q3B7I2 92 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 KRT28Q7Z3Y7 464 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 FNIP1Q8TF40 1166 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 TSG101Q99816 390 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SIAEQ9HAT2 523 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 GGA2Q9UJY4 613 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 MACROD2A1Z1Q3 448 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 H7C0C1 242 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 TK2O00142 265 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 EDN3P14138 238 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PRKAR1BP31321 381 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SLCO1A2P46721 670 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 UBXN1Q04323 297 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 STK32CQ86UX6 486 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SYCE1Q8N0S2 351 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 TTC17Q96AE7 1141 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 VPS35Q96QK1 796 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC78A2IDD5 438 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 B4E1Z4 1266 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM77I1YAP6 450 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 USP1O94782 785 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CFBP00751 764 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PRLP01236 227 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 HSD3B2P26439 372 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 HMOX2P30519 316 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 GNGT1P63211 74 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CLDN10P78369 228 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 MDH1BQ5I0G3 518 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 HGSNATQ68CP4 663 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 TMC7Q7Z402 723 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 GRAMD1AQ96CP6 724 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 HAUS1Q96CS2 278 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 COQ7Q99807 217 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 IFT22Q9H7X7 185 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 VPS37BQ9H9H4 285 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 BRD7Q9NPI1 651 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 MAP3K5Q99683 1374 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CETN3O15182 167 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 MT-ND3P03897 115 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP3A7P24462 503 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ADCY7P51828 1080 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CD300CQ08708 224 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGA8FQ08AF8 430 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CASP8Q14790 479 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 IL23RQ5VWK5 629 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SLFN13Q68D06 897 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 SCYL3Q8IZE3 742 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM57Q8N5G2 664 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CAPN10Q9HC96 672 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PANK4Q9NVE7 773 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 AIPL1Q9NZN9 384 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PDP2Q9P2J9 529 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ANAPC5Q9UJX4 755 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ERVV-2B6SEH9 535 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 RIPK2O43353 540 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 MYL4P12829 197 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 NEK4P51957 841 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CSNK2BP67870 215 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 RPP38P78345 283 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 GUCY2DQ02846 1103 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 IFFO1Q0D2I5 559 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ALFQ53S48 1182 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 TTBK2Q6IQ55 1244 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC8BQ6P9F7 803 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 CPXCR1Q8N123 301 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 FBXL16Q8N461 479 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-202ENST00000380828 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms