RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376959.6

KCNC3-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene KCNC3, Length 5,447 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3-201ENST00000376959 SNAP25P60880 206 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 ABHD8Q96I13 439 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 CHP1Q99653 195 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 TRIM49P0CI25 452 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 TRIM49CP0CI26 452 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 MCAMP43121 646 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 TSPAN17Q96FV3 270 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 C2orf40Q9H1Z8 148 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 SFNP31947 248 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 STAT3P40763 770 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 C3orf20Q8ND61 904 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 OR2W6PQ8NHA6 318 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 SLC35G2Q8TBE7 412 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 PIK3R5Q8WYR1 880 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 RASSF9O75901 435 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 ERFEQ4G0M1 354 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 GPD1LQ8N335 351 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 ASIC4Q96FT7 647 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 C9orf72Q96LT7 481 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 PSMD14O00487 310 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 PDXKO00764 312 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 FOXN1O15353 648 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 KCNN4O15554 427 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 SRGNP10124 158 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
KCNC3-201ENST00000376959 POTEFA5A3E0 1075 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 MYO1GB0I1T2 1018 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 ORC4O43929 436 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 POTEIP0CG38 1075 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 SEC24CP53992 1094 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 CYB5D1Q6P9G0 228 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 POTEGQ6S5H5 508 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 ASAP3Q8TDY4 903 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 RAB14P61106 215 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 DSG1Q02413 1049 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 ADRM1Q16186 407 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF507Q8TCN5 953 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 AP4S1Q9Y587 144 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 RSPH10B2B2RC85 870 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 RSPH10BP0C881 870 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 FCER1AP12319 257 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 C5orf58C9J3I9 102 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 APBA3O96018 575 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 QARSP47897 775 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 HDDC2Q7Z4H3 204 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 SCN4BQ8IWT1 228 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 SYBUQ9NX95 663 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 NME3Q13232 169 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 PTK7Q13308 1070 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 GRM4Q14833 912 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 SMAPO00193 183 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF263O14978 683 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 RFWD2Q8NHY2 731 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 ISCUQ9H1K1 167 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 BARHL2Q9NY43 387 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 MOSPD1Q9UJG1 213 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 PSMD3O43242 534 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 NUP107P57740 925 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 IFNEQ86WN2 208 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 TRIM62Q9BVG3 475 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 PCMTD2Q9NV79 361 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 MYL2P10916 166 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 CCDC142Q17RM4 750 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 JAMLQ86YT9 394 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 P3H2Q8IVL5 708 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 SH3KBP1Q96B97 665 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 OSBPL8Q9BZF1 889 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 USP17L15C9J2P7 530 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 USP17L11C9JVI0 530 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 USP17L18D6R9N7 530 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 USP17L22D6RA61 530 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 USP17L19D6RCP7 530 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 USP17L20D6RJB6 530 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 USP17L24Q0WX57 530 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 ZCWPW2Q504Y3 356 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 MMGT1Q8N4V1 131 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 STK33Q9BYT3 514 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 CDY2AQ9Y6F7 541 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 CDY1Q9Y6F8 540 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNC3-201ENST00000376959 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms