RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373198.8

PTPRT-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRT, Length 12,746 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-206ENST00000373198 IQCA1LA6NCM1 817 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 JAK3P52333 1124 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 TMEM62Q0P6H9 643 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 FAM160B2Q86V87 743 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 CAPN15O75808 1086 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 DGKIO75912 1065 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 HAUS5O94927 633 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 PGK2P07205 417 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 BCAR1P56945 870 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 CNGA2Q16280 664 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 CAMKK1Q8N5S9 505 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 TMEM35BQ8NCS4 154 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 FAM167AQ96KS9 214 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 GINS4Q9BRT9 223 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 TBC1D23Q9NUY8 699 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 BFARQ9NZS9 450 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 CASP8Q14790 479 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 BHMT2Q9H2M3 363 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 GPT2Q8TD30 523 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 CCDC3Q9BQI4 270 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 TEX14Q8IWB6 1497 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 ALCAMQ13740 583 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 PLCL1Q15111 1095 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 RCN1Q15293 331 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 LEMD3Q9Y2U8 911 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 DMPKQ09013 629 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 LRRC14Q15048 493 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 GSTA3Q16772 222 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 MGAT5BQ3V5L5 792 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 SHCBP1Q8NEM2 672 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 TUBGCP3Q96CW5 907 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 DNAJC12Q9UKB3 198 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 MAPRE2Q15555 327 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 UNC45BQ8IWX7 931 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 DPP10Q8N608 796 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 KIFC1Q9BW19 673 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 DYRK3O43781 588 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 C21orf2O43822 256 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 ST13P50502 369 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 SIK1P57059 783 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 CEP95Q96GE4 821 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 GALNT4Q8N4A0 578 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 DTX3LQ8TDB6 740 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 SPACA7Q96KW9 195 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 ZFATQ9P243 1243 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 PCP11498 1178 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 AP3B2Q13367 1082 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 PHACTR4Q8IZ21 702 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 THTPAQ9BU02 230 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 OSBPL6Q9BZF3 934 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 GGT7Q9UJ14 662 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 PDGFRBP09619 1106 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 PRELPP51888 382 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 TFDP2Q14188 446 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 IP6K2Q9UHH9 426 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 APPL1Q9UKG1 709 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 SPATA2Q9UM82 520 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 ERVV-2B6SEH9 535 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 LDHAP00338 332 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 PADI6Q6TGC4 694 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 A0A1W2PP64 1363 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 RHOBTB1O94844 696 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 TTC13Q8NBP0 860 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 PFKFB2O60825 505 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 ATP5HO75947 161 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 GGCXP38435 758 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 ALDH1A3P47895 512 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 CLYBLQ8N0X4 340 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 RNF181Q9P0P0 153 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 STOML1Q9UBI4 398 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 KNTC1P50748 2209 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 E9PBE3 544 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 NR3C1P04150 777 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-206ENST00000373198 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms