RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 MAPK4P31152 587 aa20.06■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 MYO1EQ12965 1108 aa20.06■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 ALCAMQ13740 583 aa20.06■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa20.06■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 TMEM63BQ5T3F8 832 aa20.06■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 KRT39Q6A163 491 aa20.06■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 SPATA21Q7Z572 469 aa20.06■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.06■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.06■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.81e-7■□□□□ 9.8
CITED2-201ENST00000367651 HEMGNQ9BXL5 484 aa20.06■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.06■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 THAP12O43422 761 aa20.06■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 GJB6O95452 261 aa20.06■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa20.06■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 EBF2Q9HAK2 575 aa20.06■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 NFIBO00712 420 aa20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 MAPK13O15264 365 aa20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 SUN1O94901 812 aa20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 ALADP13716 330 aa20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 RRM1P23921 792 aa20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 YWHABP31946 246 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 NCKAP1LP55160 1127 aa20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 COPS2P61201 443 aa20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 SLC27A3Q5K4L6 730 aa20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 KRT5P13647 590 aa20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 GPC3P51654 580 aa20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 CPA5Q8WXQ8 436 aa20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 C9orf72Q96LT7 481 aa20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 SUFUQ9UMX1 484 aa20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 COQ4Q9Y3A0 265 aa20.05■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 CLRN2A0PK11 232 aa20.04■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 ATF2P15336 505 aa20.04■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 FOXN2P32314 431 aa20.04■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 SOX10P56693 466 aa20.04■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 NSMCE1Q8WV22 266 aa20.04■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 MASTLQ96GX5 879 aa20.04■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 NT5C1BQ96P26 610 aa20.04■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 TMEM8AQ9HCN3 771 aa20.04■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 ANAPC5Q9UJX4 755 aa20.04■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa20.04■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa20.04■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 UNGP13051 313 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 ADCY8P40145 1251 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 HSD17B4P51659 736 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 TRAF1Q13077 416 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 TKFCQ3LXA3 575 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 RAB20Q9NX57 234 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 ANP32DO95626 131 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 RALAP11233 206 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 AOC3Q16853 763 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 MCOLN2Q8IZK6 566 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 FBXL13Q8NEE6 735 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 BSNDQ8WZ55 320 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 MIEF2Q96C03 454 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 KLHL29Q96CT2 875 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 DONSONQ9NYP3 566 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 TBX20Q9UMR3 447 aa20.03■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 SORBS3O60504 671 aa20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 CNGA1P29973 690 aa20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 SV2AQ7L0J3 742 aa20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 ASRGL1Q7L266 308 aa20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 STK38LQ9Y2H1 464 aa20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 ZNF536O15090 1300 aa20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 MYPNQ86TC9 1320 aa20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 CFHP08603 1231 aa20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 STX2P32856 288 aa20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 FAM212AQ96EL1 285 aa20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 TRAIPQ9BWF2 469 aa20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 ARHGEF3Q9NR81 526 aa20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 EURLQ9NYK6 297 aa20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 LGALS13Q9UHV8 139 aa20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 C15orf41Q9Y2V0 281 aa20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.02■□□□□ 0.8
CITED2-201ENST00000367651 TCEA3O75764 348 aa20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms