RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 CEP290O15078 2479 aa30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 XPOTO43592 962 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 ATP1A3P13637 1013 aa30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 DLG4P78352 724 aa30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 MAN2A1Q16706 1144 aa30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 NOMO2Q5JPE7 1267 aa30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 GSTCDQ8NEC7 633 aa30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 SLC38A7Q9NVC3 462 aa30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 PTGESO14684 152 aa30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 DGKIO75912 1065 aa30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 THP07101 528 aa30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 NFICP08651 508 aa30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM49P0CI25 452 aa30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM49CP0CI26 452 aa30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 SCNN1GP51170 649 aa30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 GRIK3Q13003 919 aa30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 KRT31Q15323 416 aa30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 GLRA4Q5JXX5 417 aa30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 CXCL16Q9H2A7 254 aa30.08■■■□□ 2.41
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM191BP0C7N4 346 aa30.07■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 GTF2H1P32780 548 aa30.07■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 DUOXA2Q1HG44 320 aa30.07■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 EFCAB13Q8IY85 973 aa30.07■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa30.07■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 CASD1Q96PB1 797 aa30.07■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 INTS13Q9NVM9 706 aa30.07■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 PTPRSQ13332 1948 aa30.06■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 C9orf50Q5SZB4 431 aa30.06■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 TNNC2P02585 160 aa30.05■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 SHHQ15465 462 aa30.05■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 C1orf220Q5T0J3 134 aa30.05■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 FAM117BQ6P1L5 589 aa30.05■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 BEST2Q8NFU1 509 aa30.05■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 MIOSQ9NXC5 875 aa30.05■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC10BA6NIK2 292 aa30.05■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 TBKBP1A7MCY6 615 aa30.05■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 GJB5O95377 273 aa30.05■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 POMCP01189 267 aa30.05■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 KCNH2Q12809 1159 aa30.05■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 ZBTB6Q15916 424 aa30.05■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 TAB2Q9NYJ8 693 aa30.05■■■□□ 2.4
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GIPC1-201ENST00000345425 BMP8BP34820 402 aa30.04■■■□□ 2.4
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GIPC1-201ENST00000345425 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 ZBED2Q9BTP6 218 aa30.04■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 MTMR12Q9C0I1 747 aa30.04■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM8AQ9HCN3 771 aa30.04■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 PLAGL2Q9UPG8 496 aa30.04■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 SERPINC1P01008 464 aa30.03■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 CYP3A5P20815 502 aa30.03■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 GATMP50440 423 aa30.03■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 COPB1P53618 953 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 PPP3CAQ08209 521 aa30.03■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 VWA3BQ502W6 1294 aa30.03■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 HERC6Q8IVU3 1022 aa30.03■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC43Q8N309 656 aa30.03■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 OR5B17Q8NGF7 314 aa30.03■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 YME1L1Q96TA2 773 aa30.03■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 MMRN2Q9H8L6 949 aa30.03■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 TBC1D13Q9NVG8 400 aa30.03■■■□□ 2.4
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GIPC1-201ENST00000345425 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa30.03■■■□□ 2.4
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GIPC1-201ENST00000345425 KRT39Q6A163 491 aa30.03■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF516Q92618 1163 aa30.03■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 NDST4Q9H3R1 872 aa30.03■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 FMO5P49326 533 aa30.02■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 MXI1P50539 228 aa30.02■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 MIIPQ5JXC2 388 aa30.02■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 VPS16Q9H269 839 aa30.02■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 DPP3Q9NY33 737 aa30.02■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 INSL6Q9Y581 213 aa30.02■■■□□ 2.4
GIPC1-201ENST00000345425 FANCCQ00597 558 aa30.01■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 TUSC3Q13454 348 aa30.01■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 BIRC3Q13489 604 aa30.01■■■□□ 2.39
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