RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329276.9

NOP56-201, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP56, Length 2,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-201ENST00000329276 C1orf54Q8WWF1 131 aa20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 GATA6Q92908 595 aa20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 DMAC2Q9NW81 257 aa20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 EXOC3O60645 756 aa20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 ADCY8P40145 1251 aa20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 RCN1Q15293 331 aa20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 NLRP9Q7RTR0 991 aa20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 CLNKQ7Z7G1 428 aa20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 ATL2Q8NHH9 583 aa20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 CFAP57Q96MR6 1250 aa20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 NUP85Q9BW27 656 aa20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 NRAPQ86VF7 1730 aa20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 PSMC4P43686 418 aa20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 ADCY1Q08828 1119 aa20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 AP1B1Q10567 949 aa20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 CETN1Q12798 172 aa20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 LMO3Q8TAP4 145 aa20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 PTPRN2Q92932 1015 aa20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 BTBD10Q9BSF8 475 aa20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 ANO3Q9BYT9 981 aa20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 BFSP1Q12934 665 aa20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 CCDC89Q8N998 374 aa20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 GBP5Q96PP8 586 aa20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 SMC6Q96SB8 1091 aa20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 SYNCQ9H7C4 482 aa20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 PPCSQ9HAB8 311 aa20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.54■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 FAM13AO94988 1023 aa20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 BTDP43251 543 aa20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 SESN3P58005 492 aa20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 AP3B2Q13367 1082 aa20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 Q4G0T1 1027 aa20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 FOXB2Q5VYV0 432 aa20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 FAM20AQ96MK3 541 aa20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 MIPEPQ99797 713 aa20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 PCMTD2Q9NV79 361 aa20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 SEL1LQ9UBV2 794 aa20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 USP21Q9UK80 565 aa20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 P4HA2O15460 535 aa20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 TRIM49P0CI25 452 aa20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 TRIM49CP0CI26 452 aa20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 CENPCQ03188 943 aa20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 SPOCK2Q92563 424 aa20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 VCX3BQ9H321 246 aa20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 TRABDQ9H4I3 376 aa20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 VCX3AQ9NNX9 186 aa20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.53■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa20.52■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.52■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 PHC3Q8NDX5 983 aa20.52■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 TTC25Q96NG3 672 aa20.52■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa20.52■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 CHST7Q9NS84 486 aa20.52■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.52■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 WNK3Q9BYP7 1800 aa20.52■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 CAPN9O14815 690 aa20.52■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 MAP3K7O43318 606 aa20.52■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 PSMG1O95456 288 aa20.52■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 PYGLP06737 847 aa20.52■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 MYBPC2Q14324 1141 aa20.52■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 NRG4Q8WWG1 115 aa20.52■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 STMN2Q93045 179 aa20.52■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 AZIN2Q96A70 460 aa20.52■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 UIMC1Q96RL1 719 aa20.52■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 DCLK3Q9C098 648 aa20.52■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.52■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 SPAG7O75391 227 aa20.51■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 RASA2Q15283 850 aa20.51■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.51■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 OTOAQ7RTW8 1153 aa20.51■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 MYCT1Q8N699 235 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 497.2 ms