RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 RNF149Q8NC42 400 aa24.53■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa24.53■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 AMACRQ9UHK6 382 aa24.53■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 GAS2O43903 313 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 TNFSF9P41273 254 aa24.52■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 MARCKSL1P49006 195 aa24.52■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 ZBTB33Q86T24 672 aa24.52■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa24.52■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 EXOC4Q96A65 974 aa24.52■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 BTBD6Q96KE9 485 aa24.52■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 ZSWIM1Q9BR11 485 aa24.52■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa24.52■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 FAM189A1O60320 539 aa24.52■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 TOM1L1O75674 476 aa24.52■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 ACO1P21399 889 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 CUL2Q13617 745 aa24.52■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 UBL4BQ8N7F7 174 aa24.52■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 SHCBP1Q8NEM2 672 aa24.52■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 TCHPQ9BT92 498 aa24.52■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 UVRAGQ9P2Y5 699 aa24.52■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 UNGP13051 313 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 GUCY2FP51841 1108 aa24.51■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 BRSK2Q8IWQ3 736 aa24.51■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.51■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 PRKCBP05771 671 aa24.5■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
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SNX18-201ENST00000326277 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa24.5■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 EXOC8Q8IYI6 725 aa24.5■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa24.5■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 PEX5P50542 639 aa24.5■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 BPIFB4P59827 614 aa24.5■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 TTLL4Q14679 1199 aa24.5■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 MAPK6Q16659 721 aa24.5■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 SCARA3Q6AZY7 606 aa24.5■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 ZNF677Q86XU0 584 aa24.5■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 CPNE8Q86YQ8 564 aa24.5■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 RHPN2Q8IUC4 686 aa24.5■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 CCDC26Q8TAB7 109 aa24.5■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 WHAMMQ8TF30 809 aa24.5■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 CD101Q93033 1021 aa24.5■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 NUB1Q9Y5A7 615 aa24.5■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 CLTAP09496 248 aa24.49■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 ECHS1P30084 290 aa24.49■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 SLC26A2P50443 739 aa24.49■■□□□ 1.51
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SNX18-201ENST00000326277 NCOA4Q13772 614 aa24.49■■□□□ 1.51
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SNX18-201ENST00000326277 MAATS1Q7Z4T9 603 aa24.49■■□□□ 1.51
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SNX18-201ENST00000326277 FAM204AQ9H8W3 233 aa24.49■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 UMODL1Q5DID0 1318 aa24.49■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa24.49■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 GLTPD2A6NH11 291 aa24.49■■□□□ 1.51
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SNX18-201ENST00000326277 TTI1O43156 1089 aa24.49■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 GJB1P08034 283 aa24.49■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 ARMCX2Q7L311 632 aa24.49■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
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SNX18-201ENST00000326277 ZBTB10Q96DT7 871 aa24.49■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 ERVK-5Q9HDB9 667 aa24.49■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 PNMA3Q9UL41 463 aa24.49■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa24.49■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 ABLIM1O14639 778 aa24.48■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 CLSTN1O94985 981 aa24.48■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 PTENP60484 403 aa24.48■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 TMEM270Q6UE05 265 aa24.48■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 MCOLN2Q8IZK6 566 aa24.48■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 C2orf40Q9H1Z8 148 aa24.48■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 PSD3Q9NYI0 1048 aa24.48■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 SPOPO43791 374 aa24.47■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 MCL1Q07820 350 aa24.47■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 CLUL1Q15846 466 aa24.47■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 WDR49Q8IV35 697 aa24.47■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 MREGQ8N565 214 aa24.47■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa24.47■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 ZMYND15Q9H091 742 aa24.47■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa24.47■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 OGTO15294 1046 aa24.47■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 HBP1O60381 514 aa24.47■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 HSF2BPO75031 334 aa24.47■■□□□ 1.51
SNX18-201ENST00000326277 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
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