RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 AFG1LQ8WV93 481 aa18.26■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa18.26■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 ARHGEF26Q96DR7 871 aa18.26■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 MS4A14Q96JA4 679 aa18.26■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 NLRP4Q96MN2 994 aa18.26■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 TINF2Q9BSI4 451 aa18.26■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 NFKBIZQ9BYH8 718 aa18.26■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 FZD8Q9H461 694 aa18.26■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 OSGEPQ9NPF4 335 aa18.26■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 PPFIA4O75335 1185 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 MMEP08473 750 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 CLCN3P51790 818 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 POU5F1BQ06416 359 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 NOGQ13253 232 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 MPZL3Q6UWV2 235 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 HDXQ7Z353 690 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 ZNF677Q86XU0 584 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 NPLOC4Q8TAT6 608 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 EHD2Q9NZN4 543 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 PTPRJQ12913 1337 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 TTLL13PA6NNM8 815 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 FAM189A1O60320 539 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 PROZP22891 400 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 PHKA2P46019 1235 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 INHBEP58166 350 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 IGBP1P78318 339 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 TMEM132AQ24JP5 1023 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 MORN1Q5T089 497 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 ATF7IP2Q5U623 682 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 HES6Q96HZ4 224 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 FUT8Q9BYC5 575 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 IMPG2Q9BZV3 1241 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 GOLPH3Q9H4A6 298 aa18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 ABLIM1O14639 778 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 TMOD1P28289 359 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 MBTD1Q05BQ5 628 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 CUL2Q13617 745 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 ACVR2BQ13705 512 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 DUSP28Q4G0W2 176 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 SEZ6Q53EL9 994 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 IQSEC1Q6DN90 963 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 ACTRT1Q8TDG2 376 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 FAM84AQ96KN4 292 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 CEP104O60308 925 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 MTA2O94776 668 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 CLTAP09496 248 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 TNFSF9P41273 254 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 TNNC1P63316 161 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 NCOA4Q13772 614 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 ACAD10Q6JQN1 1059 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 C11orf63Q6NUN7 778 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 C8orf74Q6P047 294 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 IFNL1Q8IU54 200 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 USP38Q8NB14 1042 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 OR5B17Q8NGF7 314 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 ELMO3Q96BJ8 720 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 LRRC1Q9BTT6 524 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 PTPRHQ9HD43 1115 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 ACP6Q9NPH0 428 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 L1RE1Q9UN81 338 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 TNFSF13BQ9Y275 285 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 GJB1P08034 283 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 NOP14P78316 857 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 SREBF2Q12772 1141 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 MAP2K5Q13163 448 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 IRF5Q13568 498 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 FAM187BQ17R55 369 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 DUOXA2Q1HG44 320 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 ZNF568Q3ZCX4 644 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 C17orf99Q6UX52 265 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 LINC01465Q8N7H1 131 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 OR6J1Q8NGC5 347 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 C16orf70Q9BSU1 422 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 GTF3C4Q9UKN8 822 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 COG5Q9UP83 839 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 MAP2K7O14733 419 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 SASH3O75995 380 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 CLSTN1O94985 981 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 CYP1A2P05177 515 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-201ENST00000320857 ZNF286BP0CG31 522 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms