RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320393.8

BCKDHB-201, Transcript of branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BCKDHB, Length 3,692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHB-201ENST00000320393 TLR3O15455 904 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 CYP3A4P08684 503 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 NUDT17P0C025 328 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 HSPA6P17066 643 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 KCNT1Q5JUK3 1230 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 LVRNQ6Q4G3 990 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 CFAP61Q8NHU2 1237 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 PARD3BQ8TEW8 1205 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 RILPQ96NA2 401 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 ZNF570Q96NI8 536 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 KMT5AQ9NQR1 393 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 TXNDC9O14530 226 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 MAPK13O15264 365 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 P3H4Q92791 437 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 CEP170P1Q96L14 293 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 TTC1Q99614 292 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 TXLNGQ9NUQ3 528 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 ARMCX1Q9P291 453 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 NEU2Q9Y3R4 380 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 A0A1W2PPM1 405 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 C5orf60A6NFR6 353 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 CCDC160A6NGH7 325 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 FAM47DPA6NHR8 397 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 ADRB2P07550 413 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 GHRP10912 638 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 KRT4P19013 534 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 CCND1P24385 295 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 SMARCA1P28370 1054 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 FOXN2P32314 431 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 RASSF2P50749 326 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 MTMR2Q13614 643 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 SPARCL1Q14515 664 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 PIGWQ7Z7B1 504 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 CROCCP2Q86T23 111 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 CCDC89Q8N998 374 aa14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 CES2O00748 559 aa14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 CLGNO14967 610 aa14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 CDH16O75309 829 aa14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 TMEM154Q6P9G4 183 aa14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 VSTM1Q6UX27 236 aa14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 TMEM121Q9BTD3 319 aa14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 RAB20Q9NX57 234 aa14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 E2F8A0AVK6 867 aa14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 BBOX1O75936 387 aa14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 ZCCHC18P0CG32 403 aa14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 SSTR1P30872 391 aa14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 SREBF1P36956 1147 aa14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 ORC1Q13415 861 aa14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 HERPUD2Q9BSE4 406 aa14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 MKNK1Q9BUB5 465 aa14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 OSBPL8Q9BZF1 889 aa14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 CACNA1SQ13698 1873 aa14.71□□□□□ -0.05
BCKDHB-201ENST00000320393 AP1G2O75843 785 aa14.71□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 LIN9Q5TKA1 542 aa14.71□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.71□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.71□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 LENG9Q96B70 501 aa14.71□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.71□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.71□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 KDSRQ06136 332 aa14.7□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 WLSQ5T9L3 541 aa14.7□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 SLC25A41Q8N5S1 370 aa14.7□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 GRK7Q8WTQ7 553 aa14.7□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 TSC22D3Q99576 134 aa14.7□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 SLC13A1Q9BZW2 595 aa14.7□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 VAV3Q9UKW4 847 aa14.7□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 AFF2P51816 1311 aa14.7□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 GYG2O15488 501 aa14.7□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 NRLP54845 237 aa14.7□□□□□ -0.06
BCKDHB-201ENST00000320393 JAG1P78504 1218 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms