RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285968.10

NUP205-201, Transcript of nucleoporin 205, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP205, Length 6,266 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205-201ENST00000285968 SHOC2Q9UQ13 582 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 NID2Q14112 1375 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 PIK3R2O00459 728 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 ETFBP38117 255 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 TMPRSS15P98073 1019 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 CDR2Q01850 454 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 STK4Q13043 487 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 LAMC2Q13753 1193 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 SCARF1Q14162 830 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 SNX17Q15036 470 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 MTFR1Q15390 333 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 NFIL3Q16649 462 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 IZUMO3Q5VZ72 239 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 SPATA21Q7Z572 469 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 REXO1L1PQ8IX06 675 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 MKL1Q969V6 931 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 SLC10A4Q96EP9 437 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 PGM2Q96G03 612 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 KAZALD1Q96I82 304 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 EPC1Q9H2F5 836 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 NAGPAQ9UK23 515 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 CDY2AQ9Y6F7 541 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 CDY1Q9Y6F8 540 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 KIF1AQ12756 1690 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 MYMKA6NI61 221 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 GOLGA8SH3BPF8 625 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 TDP2O95551 362 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 HSPA4LO95757 839 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 FGRP09769 529 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 GCKP35557 465 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 GGCXP38435 758 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 GCLMP48507 274 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 ACTR2P61160 394 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 GABPAQ06546 454 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 GLYCTKQ8IVS8 523 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 DNERQ8NFT8 737 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 FAF2Q96CS3 445 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 HDAC11Q96DB2 347 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 ZSWIM1Q9BR11 485 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 TRIM54Q9BYV2 358 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 PRR12Q9ULL5 1215 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 PCDHB8Q9UN66 801 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 TNS2Q63HR2 1409 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 TMEM247A6NEH6 219 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 GYG2O15488 501 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 GRK2P25098 689 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 YWHABP31946 246 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 SPRP35270 261 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 ARHGDIAP52565 204 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 ART3Q13508 389 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 TMEM270Q6UE05 265 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 NLRP9Q7RTR0 991 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 SRLQ86TD4 932 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 JAMLQ86YT9 394 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 EXD1Q8NHP7 514 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 GCNAQ96QF7 691 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 C11orf70Q9BRQ4 267 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 DBNDD1Q9H9R9 158 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 BLOC1S6Q9UL45 172 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 BCL9O00512 1426 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 LYPLA2O95372 231 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 MYL4P12829 197 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 NAMPTP43490 491 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.639e-7■■■□□ 18.1
NUP205-201ENST00000285968 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 VSNL1P62760 191 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 MAPK7Q13164 816 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 TAF11Q15544 211 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 KCTD16Q68DU8 428 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 USP17L6PQ6QN14 398 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 RAD9BQ6WBX8 426 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 C12orf56Q8IXR9 622 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 C2orf69Q8N8R5 385 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 CERKQ8TCT0 537 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 TEX12Q9BXU0 123 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 TRIM4Q9C037 500 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 MROH8Q9H579 483 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 GABBR1Q9UBS5 961 aa4.85□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 MROH2AA6NES4 1674 aa4.84□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 ROBO3Q96MS0 1386 aa4.84□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa4.84□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
NUP205-201ENST00000285968 OGTO15294 1046 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms