RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 CHMP6Q96FZ7 201 aa21.51■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.51■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 RASIP1Q5U651 963 aa21.51■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 RPAINQ86UA6 219 aa21.51■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 PARD3BQ8TEW8 1205 aa21.51■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 ATG4CQ96DT6 458 aa21.51■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 GYS2P54840 703 aa21.51■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 CASP7P55210 303 aa21.51■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 RPS6P62753 249 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.51■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 AFG1LQ8WV93 481 aa21.51■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 NLRP14Q86W24 1093 aa21.51■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 GIPC2Q8TF65 315 aa21.51■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 ZFP69BQ9UJL9 534 aa21.51■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 SNX9Q9Y5X1 595 aa21.51■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 SLC37A4O43826 429 aa21.5■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 SLC12A1Q13621 1099 aa21.5■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 NIF3L1Q9GZT8 377 aa21.5■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 SLC38A7Q9NVC3 462 aa21.5■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 SNX2O60749 519 aa21.5■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 IL1R1P14778 569 aa21.5■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 FRA10AC1Q70Z53 315 aa21.5■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 GYG2O15488 501 aa21.5■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 PSMD3O43242 534 aa21.5■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 PDGFRAP16234 1089 aa21.5■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 C1orf228Q6PIY5 440 aa21.5■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 CYTH2Q99418 400 aa21.5■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 RRN3P2A6NIE6 340 aa21.5■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 HAUS5O94927 633 aa21.5■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa21.5■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 CETPP11597 493 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 TADA2BQ86TJ2 420 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 SH2D3AQ9BRG2 576 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 KBTBD4Q9NVX7 518 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 PXDNQ92626 1479 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 LCP1P13796 627 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 MAGEA9P43362 315 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 ACADSBP45954 432 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 LAMC2Q13753 1193 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 FIGNQ5HY92 759 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 RASSF3Q86WH2 238 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 CPA5Q8WXQ8 436 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 EPC1Q9H2F5 836 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 PLAGL2Q9UPG8 496 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 KCNH4Q9UQ05 1017 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 VEPH1Q14D04 833 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 E2F5Q15329 346 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 TMTC4Q5T4D3 741 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 SLC30A5Q8TAD4 765 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 FAM129AQ9BZQ8 928 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 CFLARO15519 480 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 LRRC37BQ96QE4 947 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 TNS2Q63HR2 1409 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF185O15231 689 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 GRIN3BO60391 1043 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 DEUP1Q05D60 604 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 TAAR1Q96RJ0 339 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 NT5C1AQ9BXI3 368 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 UNC45AQ9H3U1 944 aa21.49■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 CPB1P15086 417 aa21.48■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 TPI1P60174 286 aa21.48■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 TAF11Q15544 211 aa21.48■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 PID1Q7Z2X4 250 aa21.48■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 TBX20Q9UMR3 447 aa21.48■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 ADGRB2O60241 1585 aa21.48■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.48■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 ESRRGP62508 458 aa21.48■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 EXT2Q93063 718 aa21.48■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 TTC36A6NLP5 189 aa21.48■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 ARFIP2P53365 341 aa21.48■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 Q4G0T1 1027 aa21.48■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 NUDCD3Q8IVD9 361 aa21.48■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 ANKS1AQ92625 1134 aa21.48■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 NNMTP40261 264 aa21.48■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 PRAMEP78395 509 aa21.48■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 NTRK3Q16288 839 aa21.48■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 RIOX1Q9H6W3 641 aa21.48■■□□□ 1.03
LRIG1-201ENST00000273261 BNIP3LO60238 219 aa21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms