RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RNF39Q9H2S5 420 aa22.03■■□□□ 1.12
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.02■■□□□ 1.12
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 UCHL3P15374 230 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GTF2H1P32780 548 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MXI1P50539 228 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 APBA1Q02410 837 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa21.98■■□□□ 1.11
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