RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269228.9

NPC1-201, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPC1, Length 5,157 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1-201ENST00000269228 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.53□□□□□ -0.08
NPC1-201ENST00000269228 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
NPC1-201ENST00000269228 STRNO43815 780 aa14.52□□□□□ -0.08
NPC1-201ENST00000269228 ALDH1A1P00352 501 aa14.52□□□□□ -0.08
NPC1-201ENST00000269228 NFKBIAP25963 317 aa14.52□□□□□ -0.08
NPC1-201ENST00000269228 OAZ1P54368 228 aa14.52□□□□□ -0.08
NPC1-201ENST00000269228 IRX4P78413 519 aa14.52□□□□□ -0.08
NPC1-201ENST00000269228 GPS1Q13098 491 aa14.52□□□□□ -0.08
NPC1-201ENST00000269228 TTC30AQ86WT1 665 aa14.52□□□□□ -0.08
NPC1-201ENST00000269228 ABCF3Q9NUQ8 709 aa14.52□□□□□ -0.08
NPC1-201ENST00000269228 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.52□□□□□ -0.08
NPC1-201ENST00000269228 P4HA2O15460 535 aa14.52□□□□□ -0.08
NPC1-201ENST00000269228 PCSK1P29120 753 aa14.52□□□□□ -0.08
NPC1-201ENST00000269228 NNMTP40261 264 aa14.52□□□□□ -0.08
NPC1-201ENST00000269228 ROR1Q01973 937 aa14.52□□□□□ -0.08
NPC1-201ENST00000269228 ACCSLQ4AC99 568 aa14.52□□□□□ -0.08
NPC1-201ENST00000269228 UBA3Q8TBC4 463 aa14.52□□□□□ -0.08
NPC1-201ENST00000269228 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
NPC1-201ENST00000269228 TTC25Q96NG3 672 aa14.52□□□□□ -0.08
NPC1-201ENST00000269228 TRPC7Q9HCX4 862 aa14.52□□□□□ -0.08
NPC1-201ENST00000269228 STK38LQ9Y2H1 464 aa14.52□□□□□ -0.08
NPC1-201ENST00000269228 GYPCP04921 128 aa14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 CHRNA3P32297 505 aa14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 CASP4P49662 377 aa14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 ST3GAL1Q11201 340 aa14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 MCEEQ96PE7 176 aa14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 WDR24Q96S15 920 aa14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 TJP2Q9UDY2 1190 aa14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 FIS1Q9Y3D6 152 aa14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 MRC1P22897 1456 aa14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 WDR91A4D1P6 747 aa14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 TGFB3P10600 412 aa14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 CA4P22748 312 aa14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 GTF2H1P32780 548 aa14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 SLC26A2P50443 739 aa14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 GPAT2Q6NUI2 795 aa14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 TC2NQ8N9U0 490 aa14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 TRPM4Q8TD43 1214 aa14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 VPS39Q96JC1 886 aa14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 SETD4Q9NVD3 440 aa14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 UVRAGQ9P2Y5 699 aa14.52□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 IRF6O14896 467 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 CLGNO14967 610 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 TOM1L1O75674 476 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 HMBSP08397 361 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 TAF6P49848 677 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 ERVK-9P63128 1117 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 ERVK-24P63145 666 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 DPP3Q9NY33 737 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 A0A087WZ62 844 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 NEMP1O14524 444 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 PRRG1O14668 218 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 KRT14P02533 472 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 ZSCAN26Q16670 478 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 ALS2CLQ60I27 953 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 EPAS1Q99814 870 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 NFAT5O94916 1531 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 DFFAO00273 331 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 INSRRP14616 1297 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 SLC1A1P43005 524 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 MGAT5BQ3V5L5 792 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 TRIM42Q8IWZ5 723 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 TMEM117Q9H0C3 514 aa14.51□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 GPR182O15218 404 aa14.5□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.5□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 PAMP19021 973 aa14.5□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 TPI1P60174 286 aa14.5□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 AMHR2Q16671 573 aa14.5□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa14.5□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 MPZL3Q6UWV2 235 aa14.5□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 MED15Q96RN5 788 aa14.5□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 PLAAQ9Y263 795 aa14.5□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.5□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NPC1-201ENST00000269228 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms