RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 SIX2Q9NPC8 291 aa9.41□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 ZNRF3Q9ULT6 936 aa9.41□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa9.41□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 O00370 1275 aa9.41□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 PMM2O15305 246 aa9.41□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 STK10O94804 968 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
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HERC3-201ENST00000264345 MSH2P43246 934 aa9.41□□□□□ -0.9
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HERC3-201ENST00000264345 SPATA21Q7Z572 469 aa9.41□□□□□ -0.9
HERC3-201ENST00000264345 CYP2W1Q8TAV3 490 aa9.41□□□□□ -0.9
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HERC3-201ENST00000264345 C2orf40Q9H1Z8 148 aa9.41□□□□□ -0.9
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HERC3-201ENST00000264345 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
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HERC3-201ENST00000264345 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
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HERC3-201ENST00000264345 MYH1P12882 1939 aa9.39□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 C19orf81C9J6K1 198 aa9.39□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 HLA-DRAP01903 254 aa9.39□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 NR3C2P08235 984 aa9.39□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 SCTRP47872 440 aa9.39□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 NPTX2P47972 431 aa9.39□□□□□ -0.91
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