RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261489.6

TSC22D1-201, Transcript of TSC22 domain family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSC22D1, Length 3,135 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1-201ENST00000261489 SCLYQ96I15 445 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 ACAP3Q96P50 834 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 PANX2Q96RD6 677 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 NUP58Q9BVL2 599 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 GUCA1BQ9UMX6 200 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 PLAGL2Q9UPG8 496 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 MACROD2A1Z1Q3 448 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 VNN1O95497 513 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 ITGB3P05106 788 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 DNA2P51530 1060 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 NCOA4Q13772 614 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 WDR72Q3MJ13 1102 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 PDXDC1Q6P996 788 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 CYP26C1Q6V0L0 522 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 SERINC5Q86VE9 423 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 KIF12Q96FN5 646 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 DNAJC7Q99615 494 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 TMEM8AQ9HCN3 771 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 CEP72Q9P209 647 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 PADI3Q9ULW8 664 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 STYXL1Q9Y6J8 313 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 COL1A2P08123 1366 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 MGAMO43451 1857 aa9.59□□□□□ -0.87
TSC22D1-201ENST00000261489 RCCD1A6NED2 376 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 PPEF2O14830 753 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 EVI5O60447 810 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 RECQL4O94761 1208 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 LDHAP00338 332 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 RAP1GAPP47736 663 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 TRPC3Q13507 836 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 TAF2Q6P1X5 1199 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 PALB2Q86YC2 1186 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 GLYCTKQ8IVS8 523 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 ARRDC4Q8NCT1 418 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 KREMEN1Q96MU8 473 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 SAGE1Q9NXZ1 904 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 NUB1Q9Y5A7 615 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 TET1Q8NFU7 2136 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 ZNF263O14978 683 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 NDUFA10O95299 355 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 PIGRP01833 764 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 PSMD6Q15008 389 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 NFIL3Q16649 462 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 NOTUMQ6P988 496 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 FOXR2Q6PJQ5 311 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 DEFB128Q7Z7B8 93 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 RSPH3Q86UC2 560 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 ZNF410Q86VK4 478 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 SLC47A2Q86VL8 602 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 BRSK2Q8IWQ3 736 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 SLC20A1Q8WUM9 679 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 MMS19Q96T76 1030 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 LACRTQ9GZZ8 138 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 A0A087X0T9 212 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 GNRH1P01148 92 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 FAM228BP0C875 321 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 PROZP22891 400 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 TRIM14Q14142 442 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 MYBPC2Q14324 1141 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 ZACNQ401N2 412 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 TMEM270Q6UE05 265 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 USP37Q86T82 979 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 TMTC1Q8IUR5 882 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 PACSIN1Q9BY11 444 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 POLIQ9UNA4 740 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 PPME1Q9Y570 386 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.58□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 MGEA5O60502 916 aa9.57□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 KPNA6O60684 536 aa9.57□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 TNNT1P13805 278 aa9.57□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 ABCB4P21439 1286 aa9.57□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 KIF11P52732 1056 aa9.57□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 ASIC2Q16515 512 aa9.57□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 WDR44Q5JSH3 913 aa9.57□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 SLC27A1Q6PCB7 646 aa9.57□□□□□ -0.88
TSC22D1-201ENST00000261489 SYT10Q6XYQ8 523 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms