RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253099.10

MRPL4-201, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MRPL4, Length 1,455 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4-201ENST00000253099 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 BORCS6Q96GS4 357 aa27.1■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 CWH43Q9H720 699 aa27.1■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 CA3P07451 260 aa27.09■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 DLATP10515 647 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 TMEM132DQ14C87 1099 aa27.09■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 ZBTB6Q15916 424 aa27.09■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 LRIT3Q3SXY7 679 aa27.09■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 PARD3BQ8TEW8 1205 aa27.09■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 TSPAN18Q96SJ8 248 aa27.09■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa27.09■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 MSRAQ9UJ68 235 aa27.09■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 CHD7Q9P2D1 2997 aa27.09■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 ARHGEF15O94989 841 aa27.08■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 ZNF165P49910 485 aa27.08■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 DSC1Q08554 894 aa27.08■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 SURF1Q15526 300 aa27.08■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 RAB30Q15771 203 aa27.08■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 TMEM130Q8N3G9 435 aa27.08■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 FAM84AQ96KN4 292 aa27.08■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 FNBP1Q96RU3 617 aa27.08■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 DNAJB4Q9UDY4 337 aa27.08■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 DERAQ9Y315 318 aa27.08■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 C2CD2Q9Y426 696 aa27.08■■□□□ 1.93
MRPL4-201ENST00000253099 PTPRJQ12913 1337 aa27.07■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 LINC01553A4QN01 128 aa27.07■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 DLG4P78352 724 aa27.07■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 LRSAM1Q6UWE0 723 aa27.07■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 IRF2BP1Q8IU81 584 aa27.07■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 BPIFA3Q9BQP9 254 aa27.07■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 SLC38A7Q9NVC3 462 aa27.07■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 CACNG4Q9UBN1 327 aa27.07■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa27.07■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa27.07■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 LINC00271P0C7V0 271 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 KRT13P13646 458 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 VAMP7P51809 220 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 MYL5Q02045 173 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 TUSC3Q13454 348 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 COLGALT2Q8IYK4 626 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 AOPEPQ8N6M6 819 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 TMC2Q8TDI7 906 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 GNA14O95837 355 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 TNNI1P19237 187 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 DNAJB2P25686 324 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 GUCY2FP51841 1108 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 ZNF445P59923 1031 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 BFSP1Q12934 665 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 CCDC40Q4G0X9 1142 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 FRMD5Q7Z6J6 570 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 NT5DC4Q86YG4 428 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 WDR49Q8IV35 697 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 OR5B17Q8NGF7 314 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 CGRRF1Q99675 332 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 THAP9Q9H5L6 903 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 INTS13Q9NVM9 706 aa27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 CASTOR2A6NHX0 329 aa27.05■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 PBX3P40426 434 aa27.05■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 BCAR1P56945 870 aa27.05■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 CLDN10P78369 228 aa27.05■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 NCAPHQ15003 741 aa27.05■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa27.05■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 C1orf220Q5T0J3 134 aa27.05■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 SPRED2Q7Z698 418 aa27.05■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 ZNF516Q92618 1163 aa27.05■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 RABGGTAQ92696 567 aa27.05■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 PAAF1Q9BRP4 392 aa27.05■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 TRIM49P0CI25 452 aa27.04■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 TRIM49CP0CI26 452 aa27.04■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 CYP3A5P20815 502 aa27.04■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 TAP1Q03518 808 aa27.04■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 DUOXA2Q1HG44 320 aa27.04■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 BEST2Q8NFU1 509 aa27.04■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 MTMR12Q9C0I1 747 aa27.04■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 TSPY26PQ9H489 355 aa27.04■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 FANCLQ9NW38 375 aa27.04■■□□□ 1.92
MRPL4-201ENST00000253099 XPOTO43592 962 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms