RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 KANSL3Q9P2N6 904 aa22.59■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa22.59■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.58■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.58■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.58■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 SETSIPP0DME0 302 aa22.58■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 IZUMO2Q6UXV1 221 aa22.58■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 CENPKQ9BS16 269 aa22.58■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 ADAM33Q9BZ11 813 aa22.58■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.58■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.58■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 RSPH10BP0C881 870 aa22.58■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 ATF2P15336 505 aa22.58■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 CA4P22748 312 aa22.58■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 AMPD1P23109 780 aa22.58■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 ADCY8P40145 1251 aa22.58■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 FMO5P49326 533 aa22.58■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 CDK7P50613 346 aa22.58■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 PSMC6P62333 389 aa22.58■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 GPC5P78333 572 aa22.58■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 OVGP1Q12889 678 aa22.58■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21e-19■■□□□ 13.7
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ODC1-201ENST00000234111 RINLQ6ZS11 566 aa22.58■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 RFWD2Q8NHY2 731 aa22.58■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 SLCO2A1Q92959 643 aa22.58■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 USP17L5A8MUK1 530 aa22.57■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 MEIS1O00470 390 aa22.57■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 HAUS5O94927 633 aa22.57■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 EVA1CP58658 441 aa22.57■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 ZNF365Q70YC5 407 aa22.57■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.57■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.57■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 RHBDL2Q9NX52 303 aa22.57■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.57■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.57■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 ZWINTO95229 277 aa22.57■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 GCNT3O95395 438 aa22.57■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 FAM200BP0CF97 657 aa22.57■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 GCAP28676 217 aa22.57■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 FYB2Q5VWT5 728 aa22.57■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.57■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa22.57■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 PLSCR1O15162 318 aa22.56■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 RRM1P23921 792 aa22.56■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 PTK6Q13882 451 aa22.56■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.56■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 BLOC1S6Q9UL45 172 aa22.56■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa22.56■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 A6NJR5 290 aa22.56■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.56■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 TRIM49P0CI25 452 aa22.56■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 TRIM49CP0CI26 452 aa22.56■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 KRT15P19012 456 aa22.56■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 HIC2Q96JB3 615 aa22.56■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.56■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 TMEM165Q9HC07 324 aa22.56■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 BCS1LQ9Y276 419 aa22.56■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.56■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 A0A0G2JND7 137 aa22.55■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 CETN2P41208 172 aa22.55■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 DEUP1Q05D60 604 aa22.55■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 KIF22Q14807 665 aa22.55■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa22.55■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 SMC6Q96SB8 1091 aa22.55■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 TAS2R1Q9NYW7 299 aa22.55■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 HEY2Q9UBP5 337 aa22.55■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 ATP6V1G1O75348 118 aa22.55■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 BPIFB4P59827 614 aa22.55■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 DSG1Q02413 1049 aa22.55■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 NSL1Q96IY1 281 aa22.55■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 BTG4Q9NY30 223 aa22.55■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.55■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 WDR91A4D1P6 747 aa22.54■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 MAPK6Q16659 721 aa22.54■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa22.54■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.54■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 TGFB1I1O43294 461 aa22.54■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 SORBS3O60504 671 aa22.54■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 LVRNQ6Q4G3 990 aa22.54■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.54■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
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