RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222728.3

HOXA6-201, Transcript of homeobox A6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA6, Length 989 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6-201ENST00000222728 SLC11A1P49279 550 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 DSC1Q08554 894 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 KCNT2Q6UVM3 1135 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 SLC9A9Q8IVB4 645 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 ZNF558Q96NG5 402 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 PAAF1Q9BRP4 392 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 PDE11AQ9HCR9 933 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 RFXAPO00287 272 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 GALTP07902 379 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 PPP1R2P41236 205 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 OR1G1P47890 313 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 GUCY2FP51841 1108 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 PAK1Q13153 545 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 ADAM9Q13443 819 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 TUSC3Q13454 348 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 EDRF1Q3B7T1 1238 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 ZNF697Q5TEC3 545 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 Q7L0L9 218 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 EFCAB13Q8IY85 973 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 FBXO22Q8NEZ5 403 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 KIAA1586Q9HCI6 787 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 F8W810 466 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 IL18RAPO95256 599 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 CYP24A1Q07973 514 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 NFIL3Q16649 462 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 MLKLQ8NB16 471 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 GDPD5Q8WTR4 605 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 AAASQ9NRG9 546 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 RWDD3Q9Y3V2 267 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 NRP1O14786 923 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 AKAP3O75969 853 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 RPL13P26373 211 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 LRRC63Q05C16 580 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 MYBPC2Q14324 1141 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 GRIN2CQ14957 1233 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 TMEM132DQ14C87 1099 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 TTI2Q6NXR4 508 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 CD302Q8IX05 232 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 TMEM174Q8WUU8 243 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 CCDC127Q96BQ5 260 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 SAMD11Q96NU1 681 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 MED15Q96RN5 788 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 PRDM12Q9H4Q4 367 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 ASB7Q9H672 318 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 SLC38A7Q9NVC3 462 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 PTPRJQ12913 1337 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 CSPG5O95196 566 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 ALDH2P05091 517 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 ITGB1P05556 798 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 ZBTB6Q15916 424 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 PLEKHO2Q8TD55 490 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 HASPINQ8TF76 798 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 MFSD14AQ96MC6 490 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXA6-201ENST00000222728 BICDL2A1A5D9 508 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 C5orf67F2Z3F1 127 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 CETN3O15182 167 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 FGF18O76093 207 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 DLATP10515 647 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 CLCNKBP51801 687 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 GPM6BQ13491 265 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 PSMD6Q15008 389 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 PLVAPQ9BX97 442 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 MARCH5Q9NX47 278 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 SPG21Q9NZD8 308 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 RWDD2AQ9UIY3 292 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 GRM6O15303 877 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 TYRO3Q06418 890 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 STX1AQ16623 288 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 BEST2Q8NFU1 509 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 OR5B17Q8NGF7 314 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA6-201ENST00000222728 IGSF21Q96ID5 467 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms