RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RNF39Q9H2S5 420 aa20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 POLD4Q9HCU8 107 aa20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FBXO4Q9UKT5 387 aa20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZMYND10O75800 440 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 F13A1P00488 732 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CREMQ03060 361 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MBTD1Q05BQ5 628 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 UBXN2BQ14CS0 331 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC39A14Q15043 492 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PPP2R5AQ15172 486 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 USP41Q3LFD5 358 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FUT10Q6P4F1 479 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LILRA6Q6PI73 481 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PARM1Q6UWI2 310 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BSNDQ8WZ55 320 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BORCS6Q96GS4 357 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IFT74Q96LB3 600 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZFP42Q96MM3 310 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 APOL6Q9BWW8 343 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GPR62Q9BZJ7 368 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CSRNP2Q9H175 543 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FNIP2Q9P278 1114 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CDH7Q9ULB5 785 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HES2Q9Y543 173 aa20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TSPAN1O60635 241 aa20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 AXLP30530 894 aa20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PKP1Q13835 747 aa20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BECN1Q14457 450 aa20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 STK38Q15208 465 aa20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CLIC6Q96NY7 704 aa20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RUSC1Q9BVN2 902 aa20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C2orf40Q9H1Z8 148 aa20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MIOSQ9NXC5 875 aa20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HIP1RO75146 1068 aa20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PLA2G4BP0C869 781 aa20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NAMPTP43490 491 aa20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC12A3P55017 1021 aa20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRKCQQ04759 706 aa20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NOTUMQ6P988 496 aa20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MTSS1LQ765P7 747 aa20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GPR65Q8IYL9 337 aa20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DEPTORQ8TB45 409 aa20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCDC51Q96ER9 411 aa20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EPSTI1Q96J88 318 aa20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FAM170BA6NMN3 283 aa20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PLCG1P19174 1290 aa20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NTHL1P78549 312 aa20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC44A4Q53GD3 710 aa20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LIN9Q5TKA1 542 aa20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HACE1Q8IYU2 909 aa20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CPB2Q96IY4 423 aa20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DRC1Q96MC2 740 aa20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TIPINQ9BVW5 301 aa20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ADAM28Q9UKQ2 775 aa20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GUCY2CP25092 1073 aa20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TXLNAP40222 546 aa20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PFKPQ01813 784 aa20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LMNB2Q03252 620 aa20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6A-201ENST00000006275 AMHR2Q16671 573 aa20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6A-201ENST00000006275 USP49Q70CQ1 688 aa20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RABGGTAQ92696 567 aa20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZSCAN32Q9NX65 697 aa20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms