RNA–Protein interactions for RNA: YLR048W

RPS0B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS0B, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS0B	YLR048W	YGL260W	P53056	76 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS0B	YLR048W	MRH4	P53166	561 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS0B	YLR048W	AAH1	P53909	347 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS0B	YLR048W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS0B	YLR048W	PSK1	P31374	1356 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS0B	YLR048W	RRG9	P40156	214 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	POG1	P40473	351 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	YGL159W	P53110	370 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	TOS8	P53147	276 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	PRM15	Q03262	622 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	VHS1	Q03785	461 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	YMR244W	Q04018	355 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	YAK1	P14680	807 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	ERG2	P32352	222 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	SPS18	P32572	300 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	PHO89	P38361	574 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.82	□□□□□ -1.8	not detected
RPS0B	YLR048W	YHI9	P38765	294 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	SUR2	P38992	349 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	MIC19	P43594	170 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	PDR17	P53844	350 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	YNL046W	P53956	172 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	YET3	Q07451	203 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	YOR186W	Q08560	144 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	MRX4	Q12467	430 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	COX5A	P00424	153 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	EPT1	P22140	391 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	DBF2	P22204	572 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	ZRT3	P34240	503 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	SRY1	P36007	326 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	AVT6	P40074	448 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	MMS2	P53152	137 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	YIP3	P53633	176 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	GOT1	Q03554	138 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	YDR124W	Q04608	324 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	YPL150W	Q12152	901 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	MET2	P08465	486 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	COS2	P0CX12	379 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	COS3	P0CX13	379 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	ERD2	P18414	219 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	SWD3	P38123	315 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	SMP1	P38128	452 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	GPI18	P38211	433 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	SHG1	P38337	142 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	COS4	P43542	379 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	YJL016W	P47072	561 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	BXI1	P48558	297 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	YOL029C	Q08187	201 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	HRT3	Q12347	344 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	RAX2	Q12465	1220 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	CAF4	P36130	643 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	YIL054W	P40524	105 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	YGL118C	P53132	145 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	YNG1	Q08465	219 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	YOL163W	P0CF20	169 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	GCN3	P14741	305 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	MRPL28	P36527	147 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	SRP14	P38985	146 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	RRT13	P40042	185 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	COG3	P40094	801 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	YPI1	P43587	155 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	YJR056C	P47115	236 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	YGL034C	P53186	121 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	YMR279C	Q03263	540 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RPS0B	YLR048W	COX4	P04037	155 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	CSG2	P35206	410 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	PRY2	P36110	329 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	ARN2	P38724	620 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	RPE1	P46969	238 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	YGL262W	P53054	175 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	YGR018C	P53211	109 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	SNO1	Q03144	224 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	YPL229W	Q99395	206 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	DRS2	P39524	1355 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	OAC1	P32332	324 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	FES1	P38260	290 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	MTW1	P39731	289 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	PEX17	P40155	199 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	SYS1	P41544	203 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	GTR2	P53290	341 aa		3.76	□□□□□ -1.81

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