RNA–Protein interactions for RNA: YKL216W

URA1, Transcript of Dihydroorotate dehydrogenase, yeast

Gene URA1, Length 945 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
URA1	YKL216W	ECM18	Q04623	453 aa		5.77	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	GAL83	Q04739	417 aa		5.77	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	YLR126C	Q12288	251 aa		5.77	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	PTP2	P29461	750 aa		5.76	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	VPS17	P32913	551 aa		5.76	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	MTH1	P35198	433 aa		5.76	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	NAT2	P37293	288 aa		5.76	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	QRI7	P43122	407 aa		5.76	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	RPA43	P46669	326 aa		5.76	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	SLI1	P53304	468 aa		5.76	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	AAH1	P53909	347 aa		5.76	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	SPR28	Q04921	423 aa		5.76	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	LIP2	Q06005	328 aa		5.76	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	GRC3	Q07845	632 aa		5.76	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	SOD2	P00447	233 aa		5.75	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	ECM31	P38122	312 aa		5.75	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	MRX1	P40050	688 aa		5.75	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	FIP1	P45976	327 aa		5.75	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	CCC1	P47818	322 aa		5.75	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	VOA1	P53262	265 aa		5.75	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	LAS17	Q12446	633 aa		5.75	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	SAM35	P14693	329 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	MRPL6	P32904	214 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	OKP1	P53298	406 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	VIK1	Q12045	647 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		5.74	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	AFG1	P32317	509 aa		5.73	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	THI2	P38141	450 aa		5.73	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	YAR028W	P39548	234 aa		5.73	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	YGL159W	P53110	370 aa		5.73	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	BBP1	Q12365	385 aa		5.73	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	PCL9	Q12477	304 aa		5.73	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	PPZ2	P33329	710 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	ECT1	P33412	323 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	RRG9	P40156	214 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	DLS1	P40366	167 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	SAY1	P53324	424 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	GEP3	Q08622	556 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	YOR378W	Q08902	515 aa		5.72	□□□□□ -1.49
URA1	YKL216W	SNF4	P12904	322 aa		5.71	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	YFL054C	P43549	646 aa		5.71	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	PHB2	P50085	310 aa		5.71	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		5.7	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	YBR144C	P34215	104 aa		5.7	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	PAC2	P39937	518 aa		5.7	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	YND1	P40009	630 aa		5.7	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	TTI2	P47168	421 aa		5.7	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	RMR1	P53060	241 aa		5.7	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	YLR152C	P54072	576 aa		5.7	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	RFM1	Q12192	310 aa		5.7	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	EAF3	Q12432	401 aa		5.7	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	KIN28	P06242	306 aa		5.69	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	ENA1	P13587	1091 aa		5.69	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	IMP1	P28627	190 aa		5.69	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	OAC1	P32332	324 aa		5.69	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	COQ2	P32378	372 aa		5.69	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	SDP1	P40479	209 aa		5.69	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	AGP3	P43548	558 aa		5.69	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	YJR056C	P47115	236 aa		5.69	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	YGR016W	P53209	190 aa		5.69	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	ENA2	Q01896	1091 aa		5.69	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	YDR239C	Q03780	787 aa		5.69	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	SPC24	Q04477	213 aa		5.69	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	UPS1	Q05776	175 aa		5.69	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	ENA5	Q12691	1091 aa		5.69	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		5.68	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	INO2	P26798	304 aa		5.68	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	MRX5	P47007	382 aa		5.68	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	EFM3	P47163	339 aa		5.68	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	SSN8	P47821	323 aa		5.68	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	HOT1	Q03213	719 aa		5.68	□□□□□ -1.5
URA1	YKL216W	MIX17	Q03667	156 aa		5.68	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.6 ms