RNA–Protein interactions for RNA: YJL104W

PAM16, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM16, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM16	YJL104W	OPI3	P05375	206 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	DSF1	P0CX08	502 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YNR073C	P0CX09	502 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	GPA2	P10823	449 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	ANB1	P19211	157 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	AUA1	P32450	94 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	UTR5	P32630	166 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	TOA1	P32773	286 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	COS9	P36034	407 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	SRL3	P36167	246 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	THI2	P38141	450 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	TRS20	P38334	175 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	CTR2	P38865	189 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	AIM2	P39721	246 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	KRE29	P40026	464 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	FLX1	P40464	311 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YNL320W	P42840	284 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YJR056C	P47115	236 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	PAC10	P48363	199 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YPS5	P53057	165 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YGL114W	P53134	725 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	TOS8	P53147	276 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	GET1	P53192	235 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YGR021W	P53212	290 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YNR062C	P53748	327 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	ASI3	P53983	676 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YDR274C	P87283	123 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YDC1	Q02896	317 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YMR181C	Q03231	154 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	INP1	Q03694	420 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	VPS20	Q04272	221 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YDR124W	Q04608	324 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	NAT4	Q04751	285 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	CDC123	Q05791	360 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	STE23	Q06010	1027 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	MCH1	Q07376	486 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	GAT3	Q07928	141 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	SLD7	Q08457	257 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	MDY2	Q12285	212 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	AVL9	Q12500	764 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	RMD5	Q12508	421 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	MHF2	Q3E829	80 aa		0.75	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	STE2	D6VTK4	431 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	RAD7	P06779	565 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	ERD2	P18414	219 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	ERV1	P27882	189 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	DEP1	P31385	405 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	MCM10	P32354	571 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	SEC17	P32602	292 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	SPO23	P33757	523 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	CUE1	P38428	203 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YMR134W	P40207	237 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	BMT5	P40493	336 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	ATG18	P43601	500 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	SFH5	P47008	294 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	URB2	P47108	1174 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	GTO1	P48239	356 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	MRH4	P53166	561 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	CDH1	P53197	566 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YML131W	Q03102	365 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YMR166C	Q03829	368 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YDR102C	Q03864	110 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	KRE28	Q04431	385 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	ECM18	Q04623	453 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YPR098C	Q06089	161 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	MCP1	Q12106	302 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	RLM1	Q12224	676 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	JID1	Q12350	301 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	MRX4	Q12467	430 aa		0.74	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YLR462W	O13556	202 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	CDC8	P00572	216 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	CYC3	P06182	269 aa		0.73	□□□□□ -2.29
PAM16	YJL104W	YOL162W	P0CF19	215 aa		0.73	□□□□□ -2.29

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