RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635865.1

ATRX-220, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-220ENST00000635865 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 ARF1P84077 181 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 FOXO4P98177 505 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 DLGAP5Q15398 846 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CHRNA2Q15822 529 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 TRAPPC3LQ5T215 181 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 ANKRD34AQ69YU3 496 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 TANGO2Q6ICL3 276 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 KIAA1841Q6NSI8 718 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 BORAQ6PGQ7 559 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 BTNL9Q6UXG8 535 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 KCTD1Q719H9 257 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 RNF44Q7L0R7 432 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 NLRP10Q86W26 655 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 FBXO11Q86XK2 927 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CPOQ8IVL8 374 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 RHOT1Q8IXI2 618 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 TEX11Q8IYF3 940 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 NDUFAF2Q8N183 169 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 TOP6BLQ8N6T0 577 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 ANKRD52Q8NB46 1076 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CCDC150Q8NCX0 1101 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CYP2W1Q8TAV3 490 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 FAM71BQ8TC56 605 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 HERVK_113Q902F9 699 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 EID2BQ96D98 161 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 RADILQ96JH8 1075 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CLPTM1LQ96KA5 538 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 SPATA17Q96L03 361 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 GBP4Q96PP9 640 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 ASB2Q96Q27 587 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 MPHOSPH8Q99549 860 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 KATNAL1Q9BW62 490 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 KCND1Q9NSA2 647 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 GJB4Q9NTQ9 266 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 HAUS2Q9NVX0 235 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 MARCH2Q9P0N8 246 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 ZSWIM5Q9P217 1185 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 GIMAP2Q9UG22 337 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 TCFL5Q9UL49 500 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 SNX5Q9Y5X3 404 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CDY2AQ9Y6F7 541 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 MYPNQ86TC9 1320 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa2.85□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 LMTK3Q96Q04 1460 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 A0A0B4J269 797 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 PI4KAP2A4QPH2 592 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 PRAMEF25A6NGN4 478 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 HMX3A6NHT5 357 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 AQP12BA6NM10 295 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 FAM90A27PA6NNH2 459 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 SMTNL1A8MU46 457 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 GOLGA6L22H0YM25 854 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 AHCYL1O43865 530 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 GAS2O43903 313 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 TBC1D4O60343 1298 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 DOK2O60496 412 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 FKTNO75072 461 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 TMEM127O75204 238 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 FAM155BO75949 473 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 INMTO95050 263 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 PCDH8O95206 1070 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 WISP1O95388 367 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 STARD3NLO95772 234 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 BAG2O95816 211 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 FUCA1P04066 466 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 PFKMP08237 780 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 ITGA5P08648 1049 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 SRFP11831 508 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 IDEP14735 1019 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP2.84□□□□□ -1.956e-6■□□□□ 11.3
ATRX-220ENST00000635865 EN2P19622 333 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CHMP24386 653 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 FPR2P25090 351 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 POLD2P49005 469 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 GPR15P49685 360 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CLK1P49759 484 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 EPHA5P54756 1037 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 RAC1P63000 192 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 ROM1Q03395 351 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 UBE3AQ05086 875 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 PPARAQ07869 468 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 TNK2Q07912 1038 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CUL4AQ13619 759 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 SLC12A1Q13621 1099 aa2.84□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 NOMO1Q15155 1222 aa2.84□□□□□ -1.95
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