RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-211ENST00000620030 PALB2Q86YC2 1186 aa25.85■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa25.85■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 DPP7Q9UHL4 492 aa25.85■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 SPDYE4A6NLX3 237 aa25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 SPATA31D3P0C874 917 aa25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 MCF2P10911 925 aa25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 RPL17P18621 184 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 PLA2G5P39877 138 aa25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 SMTNP53814 917 aa25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF568Q3ZCX4 644 aa25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 GLRA4Q5JXX5 417 aa25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 FAM171A1Q5VUB5 890 aa25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 CD300LGQ6UXG3 332 aa25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 ZBTB33Q86T24 672 aa25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 CALML4Q96GE6 196 aa25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 TTPALQ9BTX7 342 aa25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa25.83■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa25.83■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 TGM5O43548 720 aa25.83■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 MYBP10242 640 aa25.83■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 MAPTP10636 758 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 OSTNP61366 133 aa25.83■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 CREMQ03060 361 aa25.83■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 SIGLEC14Q08ET2 396 aa25.83■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 MPZL3Q6UWV2 235 aa25.83■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 CYP26C1Q6V0L0 522 aa25.83■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 PIK3R5Q8WYR1 880 aa25.83■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 MFSD14AQ96MC6 490 aa25.83■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 TCHPQ9BT92 498 aa25.83■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa25.83■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 LIMD1Q9UGP4 676 aa25.83■■□□□ 1.73
PPP1CC-211ENST00000620030 SYT1P21579 422 aa25.82■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 YARSP54577 528 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 PTPAQ15257 358 aa25.82■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 PLCD3Q8N3E9 789 aa25.82■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 KREMEN2Q8NCW0 462 aa25.82■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 KCNN1Q92952 543 aa25.82■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 FAM122AQ96E09 287 aa25.82■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 ASIC4Q96FT7 647 aa25.82■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 CLSTN3Q9BQT9 956 aa25.82■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 CLIC4Q9Y696 253 aa25.82■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 TOM1L1O75674 476 aa25.81■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 RFPL2O75678 378 aa25.81■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 CLCNKBP51801 687 aa25.81■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 STRN3Q13033 797 aa25.81■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 UPP1Q16831 310 aa25.81■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa25.81■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 CEP57Q86XR8 500 aa25.81■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 GLYCTKQ8IVS8 523 aa25.81■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 PBXIP1Q96AQ6 731 aa25.81■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 UROC1Q96N76 676 aa25.81■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 ACAP3Q96P50 834 aa25.81■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 ODF2LQ9ULJ1 636 aa25.81■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 B3GAT3O94766 335 aa25.8■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 KCNE1P15382 129 aa25.8■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 PLCG1P19174 1290 aa25.8■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 FGFR3P22607 806 aa25.8■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 NCKAP1LP55160 1127 aa25.8■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 RESTQ13127 1097 aa25.8■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 KARSQ15046 597 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 ZPBP2Q6X784 338 aa25.8■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC149Q6ZUS6 474 aa25.8■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 GPBP1Q86WP2 473 aa25.8■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 SNX27Q96L92 541 aa25.8■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 REEP2Q9BRK0 252 aa25.8■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 CCSER1Q9C0I3 900 aa25.8■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa25.8■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 SORCS3Q9UPU3 1222 aa25.8■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 MCM6Q14566 821 aa25.79■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 OTOP3Q7RTS5 596 aa25.79■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 HAUS6Q7Z4H7 955 aa25.79■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 RAD54LQ92698 747 aa25.79■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa25.79■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 MYO10Q9HD67 2058 aa25.79■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 ADAM12O43184 909 aa25.78■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 ASGR2P07307 311 aa25.78■■□□□ 1.72
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF131P52739 623 aa25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 156.9 ms