RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613394.4

HPS1-215, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,714 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-215ENST00000613394 IL31RAQ8NI17 732 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 SNF8Q96H20 258 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 MTFR1LQ9H019 292 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 LRRD1A4D1F6 860 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 GOLGA8RI6L899 631 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 KRT10P13645 584 aa14.72□□□□□ -0.05
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HPS1-215ENST00000613394 ALDH3A1P30838 453 aa14.72□□□□□ -0.05
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HPS1-215ENST00000613394 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.72□□□□□ -0.05
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HPS1-215ENST00000613394 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
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HPS1-215ENST00000613394 CCDC89Q8N998 374 aa14.69□□□□□ -0.06
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HPS1-215ENST00000613394 ATP6V1G2O95670 118 aa14.69□□□□□ -0.06
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HPS1-215ENST00000613394 CNGA2Q16280 664 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 ACCSLQ4AC99 568 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 RPS6KC1Q96S38 1066 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 MYH1P12882 1939 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 MYH4Q9Y623 1939 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 RFX1P22670 979 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 PPP2R5CQ13362 524 aa14.69□□□□□ -0.06
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