RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600964.1

AP2S1-208, Transcript of adaptor related protein complex 2 subunit sigma 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene AP2S1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1-208ENST00000600964 PPP2R5AQ15172 486 aa20.13■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 MFSD1Q9H3U5 465 aa20.13■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.13■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa20.12■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa20.12■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 ADAM12O43184 909 aa20.12■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 EFNA5P52803 228 aa20.12■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.12■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 DEPTORQ8TB45 409 aa20.12■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 HASPINQ8TF76 798 aa20.12■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.12■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.12■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa20.12■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 MIA3Q5JRA6 1907 aa20.12■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 FGFR3P22607 806 aa20.11■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 IL17AQ16552 155 aa20.11■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 XKR4Q5GH76 650 aa20.11■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.11■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.11■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 ASCL5Q7RTU5 278 aa20.11■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.11■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 DAW1Q8N136 415 aa20.11■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 SIX5Q8N196 739 aa20.11■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 FLCNQ8NFG4 579 aa20.11■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 KIFAP3Q92845 792 aa20.11■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.11■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 ADPGKQ9BRR6 497 aa20.11■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.11■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.11■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.11■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 SPTBN4Q9H254 2564 aa20.1■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 SRFP11831 508 aa20.1■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 HOXA9P31269 272 aa20.1■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 PTGDRQ13258 359 aa20.1■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 HTR4Q13639 388 aa20.1■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 PSMD5Q16401 504 aa20.1■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa20.1■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 PIDD1Q9HB75 910 aa20.1■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.1■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 GDAQ9Y2T3 454 aa20.1■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.1■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 MAPK7Q13164 816 aa20.09■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 RAB33AQ14088 237 aa20.09■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 UPP1Q16831 310 aa20.09■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 ATF7IP2Q5U623 682 aa20.09■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.09■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 CEP57Q86XR8 500 aa20.09■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 IFT74Q96LB3 600 aa20.09■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 TMEM134Q9H6X4 195 aa20.09■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 FBXL21Q9UKT6 434 aa20.09■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 PRR23AA6NEV1 266 aa20.08■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 K7ERI5 159 aa20.08■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 ABLIM1O14639 778 aa20.08■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 CFHP08603 1231 aa20.08■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 POU2F2P09086 479 aa20.08■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 NPTX2P47972 431 aa20.08■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 PDXDC1Q6P996 788 aa20.08■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa20.08■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 DTWD2Q8NBA8 298 aa20.08■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20.08■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa20.08■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 MTRRQ9UBK8 725 aa20.08■□□□□ 0.81
AP2S1-208ENST00000600964 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.07■□□□□ 0.8
AP2S1-208ENST00000600964 E9PMD0 336 aa20.07■□□□□ 0.8
AP2S1-208ENST00000600964 LIG1P18858 919 aa20.07■□□□□ 0.8
AP2S1-208ENST00000600964 PROZP22891 400 aa20.07■□□□□ 0.8
AP2S1-208ENST00000600964 PRPHP41219 470 aa20.07■□□□□ 0.8
AP2S1-208ENST00000600964 GRM5P41594 1212 aa20.07■□□□□ 0.8
AP2S1-208ENST00000600964 CLCNKBP51801 687 aa20.07■□□□□ 0.8
AP2S1-208ENST00000600964 NTHL1P78549 312 aa20.07■□□□□ 0.8
AP2S1-208ENST00000600964 UVSSAQ2YD98 709 aa20.07■□□□□ 0.8
AP2S1-208ENST00000600964 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.07■□□□□ 0.8
AP2S1-208ENST00000600964 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.07■□□□□ 0.8
AP2S1-208ENST00000600964 KCNK18Q7Z418 384 aa20.07■□□□□ 0.8
AP2S1-208ENST00000600964 CEP120Q8N960 986 aa20.07■□□□□ 0.8
AP2S1-208ENST00000600964 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.07■□□□□ 0.8
AP2S1-208ENST00000600964 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
AP2S1-208ENST00000600964 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa20.07■□□□□ 0.8
AP2S1-208ENST00000600964 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
AP2S1-208ENST00000600964 STK24Q9Y6E0 443 aa20.07■□□□□ 0.8
AP2S1-208ENST00000600964 PP2D1A8MPX8 630 aa20.06■□□□□ 0.8
AP2S1-208ENST00000600964 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
AP2S1-208ENST00000600964 C8AP07357 584 aa20.06■□□□□ 0.8
AP2S1-208ENST00000600964 FSHRP23945 695 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms