RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592326.1

USP36-223, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 5

Gene USP36, Length 406 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-223	ENST00000592326	USP20	Q9Y2K6	914 aa		12.46	□□□□□ -0.41
USP36-223	ENST00000592326		R4GN57	208 aa		12.46	□□□□□ -0.41
USP36-223	ENST00000592326	ANHX	E9PGG2	379 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	WNT7A	O00755	349 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	JAK2	O60674	1132 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	RECQL4	O94761	1208 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	GPC5	P78333	572 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	GUCY1B3	Q02153	619 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	HTR4	Q13639	388 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	PPP2R5A	Q15172	486 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	ZNF174	Q15697	407 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	PARM1	Q6UWI2	310 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	IFT74	Q96LB3	600 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	MYO10	Q9HD67	2058 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	PIEZO1	Q92508	2521 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	PLXNA3	P51805	1871 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	ACKR2	O00590	384 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	PTGES	O14684	152 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	CYP11B2	P19099	503 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	OR1D2	P34982	312 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	FAM187B	Q17R55	369 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	POTEG	Q6S5H5	508 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	MTSS1L	Q765P7	747 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	BSND	Q8WZ55	320 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	FGF14	Q92915	247 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	FOXQ1	Q9C009	403 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	POLD4	Q9HCU8	107 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	ADAM12	O43184	909 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	B3GAT3	O94766	335 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	OR52Z1	P0C646	297 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	NAMPT	P43490	491 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	ITFG1	Q8TB96	612 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	FGF13	Q92913	245 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	BCO2	Q9BYV7	579 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	CCDC169	A6NNP5	214 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326		K7ERI5	159 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	TRAPPC3	O43617	180 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	LRRN2	O75325	713 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	PAPLN	O95428	1278 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	SP9	P0CG40	484 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	RPA1	P27694	616 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	HOXA9	P31269	272 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	ELF1	P32519	619 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	CLCNKB	P51801	687 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	EFNA5	P52803	228 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	ARPP19	P56211	112 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	STARD6	P59095	220 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	OSTN	P61366	133 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	RAB33A	Q14088	237 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	UVSSA	Q2YD98	709 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	PJA1	Q8NG27	643 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	ING5	Q8WYH8	240 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	C8orf76	Q96K31	380 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	KXD1	Q9BQD3	176 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP36-223	ENST00000592326	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		12.41	□□□□□ -0.42

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