RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 NT5DC4Q86YG4 428 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 ARRDC4Q8NCT1 418 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF18AQ8NI77 898 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 CHP1Q99653 195 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 HAUS4Q9H6D7 363 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 SIX2Q9NPC8 291 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 EVPLQ92817 2033 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM191BP0C7N4 346 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 DARSP14868 501 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 PRKCIP41743 596 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF11P52732 1056 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 KIZQ2M2Z5 673 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 ZACNQ401N2 412 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM47CQ5HY64 1035 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF662Q6ZS27 426 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 KLHDC9Q8NEP7 349 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 TSPAN18Q96SJ8 248 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 CDT1Q9H211 546 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 ADAMTS10Q9H324 1103 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 ASB7Q9H672 318 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 TSPAN1O60635 241 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 ASGR1P07306 291 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 GRK4P32298 578 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 JAM2P57087 298 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF5AQ12840 1032 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 TRPC3Q13507 836 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNA10Q16322 511 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 NBPF20Q3BBV1 942 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 C1orf220Q5T0J3 134 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC27A1Q6PCB7 646 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 NYAP1Q6ZVC0 841 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAJB3Q8WWF6 145 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 PDE11AQ9HCR9 933 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1B0GUA9 196 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 F8VZ95 297 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 TREHO43280 583 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 B4GALT4O60513 344 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 GPR32O75388 356 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 CLSTN1O94985 981 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 YARSP54577 528 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 BPIFB4P59827 614 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 GCNT1Q02742 428 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 THNSL1Q8IYQ7 743 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 HACE1Q8IYU2 909 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 PLEKHO2Q8TD55 490 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 TAF4BQ92750 862 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 GLT1D1Q96MS3 346 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 DESI2Q9BSY9 194 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 PDZD7Q9H5P4 517 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 MINDY3Q9H8M7 445 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 NOD1Q9Y239 953 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 GINS2Q9Y248 185 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 INHAP05111 366 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 ARID5AQ03989 594 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 MTF1Q14872 753 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 AMHR2Q16671 573 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 RPAINQ86UA6 219 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 REXO1L1PQ8IX06 675 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 PPM1KQ8N3J5 372 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 LMO3Q8TAP4 145 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB10Q96DT7 871 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM212AQ96EL1 285 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 FAXDC2Q96IV6 333 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 ACAP3Q96P50 834 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 TRPV2Q9Y5S1 764 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 ABLIM1O14639 778 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 B4GALT5O43286 388 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 CAND2O75155 1236 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 LCA5LO95447 670 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 VAV2P52735 878 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 ETF1P62495 437 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC18A3Q16572 532 aa24.4■■□□□ 1.5
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