RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589419.1

CCBE1-204, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

TSL 4

Gene CCBE1, Length 587 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-204ENST00000589419 CCZ1BP86790 482 aa14.99□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.99□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.99□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.99□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 NT5DC4Q86YG4 428 aa14.99□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.99□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 FBXL13Q8NEE6 735 aa14.99□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 LMO3Q8TAP4 145 aa14.99□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 TSPAN18Q96SJ8 248 aa14.99□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 TRPV6Q9H1D0 765 aa14.99□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 TMX1Q9H3N1 280 aa14.99□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa14.99□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 SIX2Q9NPC8 291 aa14.99□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa14.99□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 EPHB6O15197 1021 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 CD4P01730 458 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 CXCL8P10145 99 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 COL6A1P12109 1028 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 CKBP12277 381 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 UCHL3P15374 230 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 SLC9A1P19634 815 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 KCNJ6P48051 423 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 ADKP55263 362 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 WNT7BP56706 349 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 BFSP2Q13515 415 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 SEZ6Q53EL9 994 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 SV2AQ7L0J3 742 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 ZSCAN30Q86W11 494 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 FMNL3Q8IVF7 1028 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 CEP120Q8N960 986 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 OR8K1Q8NGG5 319 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 CPLX3Q8WVH0 158 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 BAP1Q92560 729 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 FAM81BQ96LP2 452 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 ACAP3Q96P50 834 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 APEX2Q9UBZ4 518 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 DERAQ9Y315 318 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 C2CD2Q9Y426 696 aa14.98□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 PTPRJQ12913 1337 aa14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 PITPNM1O00562 1244 aa14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 RAB27AP51159 221 aa14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 CDK17Q00537 523 aa14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 LRMPQ12912 555 aa14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 PAK2Q13177 524 aa14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 LPIN1Q14693 890 aa14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 MEA1Q16626 185 aa14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 UBXN11Q5T124 520 aa14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 PDXDC1Q6P996 788 aa14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 TMEM139Q8IV31 216 aa14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 HACE1Q8IYU2 909 aa14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 TOX2Q96NM4 488 aa14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 TRAIPQ9BWF2 469 aa14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 RAB20Q9NX57 234 aa14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 HTTP42858 3142 aa14.97□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 ARHGAP6O43182 974 aa14.96□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 TNNC2P02585 160 aa14.96□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 TMEM191BP0C7N4 346 aa14.96□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 SKILP12757 684 aa14.96□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 ACTN1P12814 892 aa14.96□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 SELPP16109 830 aa14.96□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 PIK3CAP42336 1068 aa14.96□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 YARSP54577 528 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 OSTNP61366 133 aa14.96□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 GOLGA8FQ08AF8 430 aa14.96□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa14.96□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.96□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa14.96□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.96□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.96□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 TMEM192Q8IY95 271 aa14.96□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 TAS1R2Q8TE23 839 aa14.96□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 ZNF516Q92618 1163 aa14.96□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa14.96□□□□□ -0.01
CCBE1-204ENST00000589419 SNX27Q96L92 541 aa14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.5 ms