RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589318.5

DDX39A-209, Transcript of DExD-box helicase 39A, human

TSL 1 (best)

Gene DDX39A, Length 1,903 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39A-209	ENST00000589318	CASP8	Q14790	479 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	MAPK6	Q16659	721 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	MAP9	Q49MG5	647 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	WDR93	Q6P2C0	686 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	TRPV1	Q8NER1	839 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	SPAG5	Q96R06	1193 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	GABRQ	Q9UN88	632 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	KIF5C	O60282	957 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	IQCF3	P0C7M6	154 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	FCGRT	P55899	365 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	KRT83	P78385	493 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	POU5F1B	Q06416	359 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	TFDP1	Q14186	410 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	PSMD6	Q15008	389 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	ASIC2	Q16515	512 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	SEMA4D	Q92854	862 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318		Q9Y3F1	56 aa		16.62	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318		F8VZ95	297 aa		16.61	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		16.61	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	TOM1L1	O75674	476 aa		16.61	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	PROZ	P22891	400 aa		16.61	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	GTF2H1	P32780	548 aa		16.61	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	PRKCI	P41743	596 aa		16.61	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	16.61	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	ARID5A	Q03989	594 aa		16.61	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	16.61	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	KRT39	Q6A163	491 aa		16.61	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		16.61	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		16.61	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF516	Q92618	1163 aa		16.61	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM84A	Q96KN4	292 aa		16.61	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	CAPNS2	Q96L46	248 aa		16.61	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	STK33	Q9BYT3	514 aa		16.61	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		16.61	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		16.61	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		16.61	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	ANK1	P16157	1881 aa		16.61	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	ACKR2	O00590	384 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	B4GALT5	O43286	388 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	VTN	P04004	478 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	SV2A	Q7L0J3	742 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	TRIB2	Q92519	343 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	ABCB6	Q9NP58	842 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	PTPRJ	Q12913	1337 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318		A0A087WZ62	844 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	HAS3	O00219	553 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	CLDN3	O15551	220 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	AKR1B10	O60218	316 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	RFX1	P22670	979 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	VAV2	P52735	878 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	PTK2	Q05397	1052 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	MCL1	Q07820	350 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	CETN1	Q12798	172 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	USP37	Q86T82	979 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	SETD4	Q9NVD3	440 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	AKT3	Q9Y243	479 aa		16.6	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	HTT	P42858	3142 aa		16.59	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		16.59	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	CYBA	P13498	195 aa		16.59	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	SOX5	P35711	763 aa		16.59	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	FLT3LG	P49771	235 aa		16.59	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	GPC3	P51654	580 aa		16.59	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	HIC1	Q14526	733 aa		16.59	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	AMHR2	Q16671	573 aa		16.59	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM187B	Q17R55	369 aa		16.59	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		16.59	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	SEZ6	Q53EL9	994 aa		16.59	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		16.59	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	16.59	■□□□□ 0.25
DDX39A-209	ENST00000589318	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	16.59	■□□□□ 0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms