RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 RGL1Q9NZL6 768 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-205ENST00000588780 VAV3Q9UKW4 847 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-205ENST00000588780 MAN2B1O00754 1011 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-205ENST00000588780 B4GALT5O43286 388 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-205ENST00000588780 RETP07949 1114 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-205ENST00000588780 CYP4A11Q02928 519 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-205ENST00000588780 MBTD1Q05BQ5 628 aa24.16■■□□□ 1.46
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CAPNS1-205ENST00000588780 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-205ENST00000588780 NTRK3Q16288 839 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-205ENST00000588780 UVSSAQ2YD98 709 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-205ENST00000588780 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM20AQ96MK3 541 aa24.16■■□□□ 1.46
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CAPNS1-205ENST00000588780 ZBTB39O15060 712 aa24.15■■□□□ 1.46
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CAPNS1-205ENST00000588780 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
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CAPNS1-205ENST00000588780 DYDC2Q96IM9 177 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-205ENST00000588780 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-205ENST00000588780 SEMA4GQ9NTN9 838 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-205ENST00000588780 GDE1Q9NZC3 331 aa24.15■■□□□ 1.46
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CAPNS1-205ENST00000588780 CCR3P51677 355 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 CAPSQ13938 189 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 TANGO2Q6ICL3 276 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 ASAP3Q8TDY4 903 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 DNASE1L2Q92874 299 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 CHRDQ9H2X0 955 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 LMAN1LQ9HAT1 526 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 NID2Q14112 1375 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 LRP3O75074 770 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 THP07101 528 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 FZD5Q13467 585 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 RAB33AQ14088 237 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 AMHR2Q16671 573 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 IL31Q6EBC2 164 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 PRR23CQ6ZRP0 262 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 KRT25Q7Z3Z0 450 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 ELSPBP1Q96BH3 223 aa24.13■■□□□ 1.45
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CAPNS1-205ENST00000588780 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 USP24Q9UPU5 2620 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 POU2F2P09086 479 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM3CQ92520 227 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 ZFP14Q9HCL3 533 aa24.12■■□□□ 1.45
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CAPNS1-205ENST00000588780 CHD6Q8TD26 2715 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 CPLX1O14810 134 aa24.11■■□□□ 1.45
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CAPNS1-205ENST00000588780 POU5F1BQ06416 359 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC5A9Q2M3M2 681 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 PPP4R3AQ6IN85 833 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 IER2Q9BTL4 223 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 KCNMB3Q9NPA1 279 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A1B0GUA9 196 aa24.1■■□□□ 1.45
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CAPNS1-205ENST00000588780 GDF9O60383 454 aa24.1■■□□□ 1.45
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CAPNS1-205ENST00000588780 PTPN2P17706 415 aa24.1■■□□□ 1.45
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CAPNS1-205ENST00000588780 CXCL12P48061 93 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 CSRP2Q16527 193 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 IRF7Q92985 503 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 F5P12259 2224 aa24.1■■□□□ 1.45
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CAPNS1-205ENST00000588780 DEXIO95424 95 aa24.09■■□□□ 1.45
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CAPNS1-205ENST00000588780 DAGLBQ8NCG7 672 aa24.09■■□□□ 1.45
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CAPNS1-205ENST00000588780 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
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CAPNS1-205ENST00000588780 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 M0R2N6 131 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 DGAT1O75907 488 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 BAG4O95429 457 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 GDI1P31150 447 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 FNTBP49356 437 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 SATB1Q01826 763 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-205ENST00000588780 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
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