RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587269.5

SMAD2-208, Transcript of SMAD family member 2, human

TSL 3

Gene SMAD2, Length 1,042 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD2-208	ENST00000587269	SLC16A4	O15374	487 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	BMP15	O95972	392 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	GUCY2C	P25092	1073 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	UBA7	P41226	1012 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	OSTN	P61366	133 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	AK8	Q96MA6	479 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	TGM5	O43548	720 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	ASGR2	P07307	311 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	PLA2G4B	P0C869	781 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	HYI	Q5T013	277 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	BRAP	Q7Z569	592 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	DAW1	Q8N136	415 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	UROC1	Q96N76	676 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	PRRX2	Q99811	253 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	KCND2	Q9NZV8	630 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	TRAPPC3	O43617	180 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	RFPL2	O75678	378 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	B3GAT3	O94766	335 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	GRM5	P41594	1212 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	PSMD5	Q16401	504 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	RTP2	Q5QGT7	225 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	ACAP3	Q96P50	834 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	PNMA5	Q96PV4	448 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	PLS3	P13797	630 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	32.35	■■■□□ 2.77	4e-8	■■■■■ 29.6
SMAD2-208	ENST00000587269	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	ASIC4	Q96FT7	647 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	CDT1	Q9H211	546 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269		H0YCG3	227 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	SLC26A4	O43511	780 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	BRD1	O95696	1058 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	MCF2	P10911	925 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	PDC	P20941	246 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	MAPK7	Q13164	816 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	LIN9	Q5TKA1	542 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	NAB2	Q15742	525 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	PLXNA3	P51805	1871 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SMAD2-208	ENST00000587269	CLCNKB	P51801	687 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	LILRA6	Q6PI73	481 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	BICD1	Q96G01	975 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	CLUH	O75153	1309 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	SLC12A3	P55017	1021 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	CEP120	Q8N960	986 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	MYH11	P35749	1972 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	TDG	Q13569	410 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	TOM1L1	O75674	476 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	ZMYND10	O75800	440 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	UPP1	Q16831	310 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	TRIP11	Q15643	1979 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	CLDN3	O15551	220 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	AVPR2	P30518	371 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	PTPN5	P54829	565 aa		32.28	■■■□□ 2.76

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