RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584216.5

COPS3-218, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene COPS3, Length 876 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3-218ENST00000584216 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
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COPS3-218ENST00000584216 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
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COPS3-218ENST00000584216 TRAPPC3O43617 180 aa14.77□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 CD72P21854 359 aa14.77□□□□□ -0.05
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COPS3-218ENST00000584216 OR1D2P34982 312 aa14.77□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
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COPS3-218ENST00000584216 PAAF1Q9BRP4 392 aa14.77□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.77□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.77□□□□□ -0.05
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COPS3-218ENST00000584216 MTRRQ9UBK8 725 aa14.77□□□□□ -0.05
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COPS3-218ENST00000584216 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.76□□□□□ -0.05
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COPS3-218ENST00000584216 ANKS3Q6ZW76 656 aa14.76□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.76□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 ELSPBP1Q96BH3 223 aa14.76□□□□□ -0.05
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COPS3-218ENST00000584216 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.76□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.76□□□□□ -0.05
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COPS3-218ENST00000584216 STK36Q9NRP7 1315 aa14.75□□□□□ -0.05
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COPS3-218ENST00000584216 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 PTGESO14684 152 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 USO1O60763 962 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 LRP3O75074 770 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 KRT37O76014 449 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 RECQL4O94761 1208 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 LRG1P02750 347 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 RHOP08100 348 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 FGFR3P22607 806 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 STK3Q13188 491 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 MAPK6Q16659 721 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
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COPS3-218ENST00000584216 NETO1Q8TDF5 533 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 ING5Q8WYH8 240 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 WASF1Q92558 559 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 UROC1Q96N76 676 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 HEBP1Q9NRV9 189 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 CACNG4Q9UBN1 327 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 CEP250Q9BV73 2442 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 ZNF197O14709 1029 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 ADAM12O43184 909 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
COPS3-218ENST00000584216 B3GAT3O94766 335 aa14.74□□□□□ -0.05
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