RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571178.1

PAM16-202, Transcript of presequence translocase associated motor 16, humanhuman

TSL 3

Gene PAM16, Length 353 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAM16-202ENST00000571178 ABLIM1O14639 778 aa16■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 NARSO43776 548 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 PLA2G4BP0C869 781 aa16■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 AVPR2P30518 371 aa16■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 PRPHP41219 470 aa16■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 EFNA5P52803 228 aa16■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 SLC12A3P55017 1021 aa16■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 PPP2R5AQ15172 486 aa16■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 FAM173BQ6P4H8 233 aa16■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 ALKAL1Q6UXT8 129 aa16■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 ADPGKQ9BRR6 497 aa16■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 TTPALQ9BTX7 342 aa16■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 HAPLN2Q9GZV7 340 aa16■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 TNFSF13BQ9Y275 285 aa16■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 CARNS1A5YM72 827 aa15.99■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 SPAG1Q07617 926 aa15.99■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 TCF15Q12870 199 aa15.99■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 RILPL1Q5EBL4 403 aa15.99■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 SPECC1Q5M775 1068 aa15.99■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 USP49Q70CQ1 688 aa15.99■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 RAB34Q9BZG1 259 aa15.99■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 KCNK12Q9HB15 430 aa15.99■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 FAM86C1Q9NVL1 165 aa15.99■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa15.99■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 SORCS3Q9UPU3 1222 aa15.99■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 MYO10Q9HD67 2058 aa15.98■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 PI15O43692 258 aa15.98■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 TKTP29401 623 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa15.98■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 TMEM119Q4V9L6 283 aa15.98■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 HYIQ5T013 277 aa15.98■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa15.98■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 CCDC149Q6ZUS6 474 aa15.98■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa15.98■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 TCHPQ9BT92 498 aa15.98■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 IKZF4Q9H2S9 585 aa15.98■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 TMEM134Q9H6X4 195 aa15.98■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 FNIP2Q9P278 1114 aa15.98■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa15.98■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 LAD1O00515 517 aa15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 CCL16O15467 120 aa15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 B3GAT3O94766 335 aa15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 PROZP22891 400 aa15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 GUCY2CP25092 1073 aa15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 OR1D2P34982 312 aa15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 GRM5P41594 1212 aa15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 MTMR3Q13615 1198 aa15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 MCM6Q14566 821 aa15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 PSMD5Q16401 504 aa15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 UPP1Q16831 310 aa15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 ZNF568Q3ZCX4 644 aa15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 POTEHQ6S545 545 aa15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 TMEM105Q8N8V8 129 aa15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 PRKD2Q9BZL6 878 aa15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 PIDD1Q9HB75 910 aa15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 STK39Q9UEW8 545 aa15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 USTQ9Y2C2 406 aa15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 CLIC4Q9Y696 253 aa15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa15.97■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 43.1
PAM16-202ENST00000571178 ZMYND10O75800 440 aa15.96■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 MAPTP10636 758 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 PLS3P13797 630 aa15.96■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 FGFR3P22607 806 aa15.96■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 KARSQ15046 597 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 SLC10A6Q3KNW5 377 aa15.96■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 XKR4Q5GH76 650 aa15.96■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa15.96■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 OTOP3Q7RTS5 596 aa15.96■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 PLCD3Q8N3E9 789 aa15.96■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 PIK3R5Q8WYR1 880 aa15.96■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 DRC1Q96MC2 740 aa15.96■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa15.96■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa15.96■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 STK24Q9Y6E0 443 aa15.96■□□□□ 0.15
PAM16-202ENST00000571178 CLUHO75153 1309 aa15.95■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 PLXNA3P51805 1871 aa15.95■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 ZNF318Q5VUA4 2279 aa15.95■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 H0Y858 1186 aa15.95■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 NPR3P17342 541 aa15.95■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 MRE11P49959 708 aa15.95■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 GUCY2FP51841 1108 aa15.95■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 MPZL3Q6UWV2 235 aa15.95■□□□□ 0.14
PAM16-202ENST00000571178 UBALD2Q8IYN6 164 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms