RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 KCNN1Q92952 543 aa24.88■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 PORCNQ9H237 461 aa24.88■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 C1orf112Q9NSG2 853 aa24.88■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 GLRA2P23416 452 aa24.88■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 SEL1L2Q5TEA6 688 aa24.88■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 KDM7AQ6ZMT4 941 aa24.88■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 SEPT14Q6ZU15 432 aa24.88■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 TMC3Q7Z5M5 1100 aa24.88■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 FAM81BQ96LP2 452 aa24.88■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 ERP44Q9BS26 406 aa24.88■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 TRIM31Q9BZY9 425 aa24.88■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 TMBIM4Q9HC24 238 aa24.88■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 CALCAP01258 141 aa24.87■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 CTNNA2P26232 953 aa24.87■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 WNT7BP56706 349 aa24.87■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24.87■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 SPOPO43791 374 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 PEX10O60683 326 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 GGPS1O95749 300 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 TREML2Q5T2D2 321 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 JAMLQ86YT9 394 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 PRELID2Q8N945 189 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 GLG1Q92896 1179 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 CEP89Q96ST8 783 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 HAPLN2Q9GZV7 340 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 PIGRP01833 764 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 HLA-DRAP01903 254 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 PYGMP11217 842 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 CHRNA3P32297 505 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 ARL2P36404 184 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 PTGIRP43119 386 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 NAMPTP43490 491 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 ZACNQ401N2 412 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 EMC10Q5UCC4 262 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 OR2W6PQ8NHA6 318 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 FNBP1Q96RU3 617 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa24.86■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 LRRIQ4A6NIV6 560 aa24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 ACOT2P49753 483 aa24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 ZNF844Q08AG5 666 aa24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 VGLL4Q14135 290 aa24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 LBX2Q6XYB7 198 aa24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 DEPTORQ8TB45 409 aa24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 C18orf8Q96DM3 657 aa24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 PTPRJQ12913 1337 aa24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 GOLGA6L10A6NI86 522 aa24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 TNNI1P19237 187 aa24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 NR1D1P20393 614 aa24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 SCP2P22307 547 aa24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 ATP1A2P50993 1020 aa24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 WDR44Q5JSH3 913 aa24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 BTBD7Q9P203 1132 aa24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 RASAL2Q9UJF2 1139 aa24.85■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 A6NNZ2 444 aa24.84■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 PIK3CAP42336 1068 aa24.84■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 TUBB8Q3ZCM7 444 aa24.84■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 FMO2Q99518 471 aa24.84■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa24.84■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 RSPH14Q9UHP6 348 aa24.84■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa24.83■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 K7ERI5 159 aa24.83■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 VNN1O95497 513 aa24.83■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 MYZAPP0CAP1 466 aa24.83■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 UNGP13051 313 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 PDCLQ13371 301 aa24.83■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 SLFN12LQ6IEE8 588 aa24.83■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 RIOX2Q8IUF8 465 aa24.83■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 GPC2Q8N158 579 aa24.83■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 SLC7A3Q8WY07 619 aa24.83■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 PCYT2Q99447 389 aa24.83■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 TXLNGYQ9BZA5 131 aa24.83■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 PCYOX1Q9UHG3 505 aa24.83■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa24.83■■□□□ 1.57
EHD4-202ENST00000569223 OTOFQ9HC10 1997 aa24.83■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 PPFIA2O75334 1257 aa24.83■■□□□ 1.56
EHD4-202ENST00000569223 TTC27Q6P3X3 843 aa24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms