RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 MCL1Q07820 350 aa23.03■■□□□ 1.28
SNAP23-216ENST00000568331 GLRA4Q5JXX5 417 aa23.03■■□□□ 1.28
SNAP23-216ENST00000568331 FUT10Q6P4F1 479 aa23.03■■□□□ 1.28
SNAP23-216ENST00000568331 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa23.03■■□□□ 1.28
SNAP23-216ENST00000568331 PPFIBP1Q86W92 1011 aa23.03■■□□□ 1.28
SNAP23-216ENST00000568331 SFR1Q86XK3 245 aa23.03■■□□□ 1.28
SNAP23-216ENST00000568331 IQUBQ8NA54 791 aa23.03■■□□□ 1.28
SNAP23-216ENST00000568331 VN1R2Q8NFZ6 395 aa23.03■■□□□ 1.28
SNAP23-216ENST00000568331 CXCL16Q9H2A7 254 aa23.03■■□□□ 1.28
SNAP23-216ENST00000568331 CUEDC2Q9H467 287 aa23.03■■□□□ 1.28
SNAP23-216ENST00000568331 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa23.03■■□□□ 1.28
SNAP23-216ENST00000568331 CUL9Q8IWT3 2517 aa23.03■■□□□ 1.28
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SNAP23-216ENST00000568331 GTF2BQ00403 316 aa23.02■■□□□ 1.28
SNAP23-216ENST00000568331 AMPD3Q01432 767 aa23.02■■□□□ 1.28
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SNAP23-216ENST00000568331 USP41Q3LFD5 358 aa23.02■■□□□ 1.28
SNAP23-216ENST00000568331 SHC4Q6S5L8 630 aa23.02■■□□□ 1.28
SNAP23-216ENST00000568331 TAS1R1Q7RTX1 841 aa23.02■■□□□ 1.28
SNAP23-216ENST00000568331 DHX58Q96C10 678 aa23.02■■□□□ 1.28
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SNAP23-216ENST00000568331 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SNAP23-216ENST00000568331 SLC38A7Q9NVC3 462 aa23.02■■□□□ 1.28
SNAP23-216ENST00000568331 CACNG4Q9UBN1 327 aa23.02■■□□□ 1.28
SNAP23-216ENST00000568331 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.02■■□□□ 1.28
SNAP23-216ENST00000568331 PCDHA7Q9UN72 937 aa23.02■■□□□ 1.28
SNAP23-216ENST00000568331 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa23.02■■□□□ 1.28
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SNAP23-216ENST00000568331 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
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SNAP23-216ENST00000568331 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.01■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 ANKRD54Q6NXT1 300 aa23.01■■□□□ 1.27
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SNAP23-216ENST00000568331 SMRP1Q8NCR6 262 aa23.01■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 SNX27Q96L92 541 aa23.01■■□□□ 1.27
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SNAP23-216ENST00000568331 PAAF1Q9BRP4 392 aa23.01■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 TNMDQ9H2S6 317 aa23.01■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa23.01■■□□□ 1.27
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SNAP23-216ENST00000568331 ZNF720Q7Z2F6 126 aa23■■□□□ 1.27
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SNAP23-216ENST00000568331 EFEMP2O95967 443 aa22.99■■□□□ 1.27
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SNAP23-216ENST00000568331 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
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SNAP23-216ENST00000568331 E2F4Q16254 413 aa22.99■■□□□ 1.27
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SNAP23-216ENST00000568331 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.99■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.99■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 CNTN3Q9P232 1028 aa22.99■■□□□ 1.27
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SNAP23-216ENST00000568331 ADH1AP07327 375 aa22.98■■□□□ 1.27
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SNAP23-216ENST00000568331 RESP18Q5W5W9 173 aa22.98■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.98■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.98■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 SLC22A17Q8WUG5 538 aa22.98■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 APOL5Q9BWW9 433 aa22.98■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.98■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.98■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.98■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
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