RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568107.2

GAN-202, Transcript of gigaxonin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GAN, Length 15,244 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAN-202ENST00000568107 DCTN3O75935 186 aa8.51□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 PDHBP11177 359 aa8.51□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 ITGA4P13612 1032 aa8.51□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 SREBF2Q12772 1141 aa8.51□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa8.51□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 TRIM4Q9C037 500 aa8.51□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 TYK2P29597 1187 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 CCL15Q16663 113 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 DGKDQ16760 1214 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 C16orf86Q6ZW13 317 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 STXBP3O00186 592 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 ARSEP51690 589 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 DEFB129Q9H1M3 183 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 BFARQ9NZS9 450 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 MMEP08473 750 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 MYBP10242 640 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 REEP2Q9BRK0 252 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 PDXKO00764 312 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 GTF2H3Q13889 308 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 MORC4Q8TE76 937 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 MYO1DO94832 1006 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 GGCXP38435 758 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 PGBD3Q8N328 593 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 FAM151AQ8WW52 585 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 EXOC4Q96A65 974 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 NRBF2Q96F24 287 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 ERAP1Q9NZ08 941 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 ZFP69BQ9UJL9 534 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 PFASO15067 1338 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 CHRNA3P32297 505 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 SBK1Q52WX2 424 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 GNASQ5JWF2 1037 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 IL31Q6EBC2 164 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 TEX12Q9BXU0 123 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 STK33Q9BYT3 514 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 KIF17Q9P2E2 1029 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 SYCE1LA8MT33 242 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 MAGEB2O15479 319 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 SLC1A1P43005 524 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 NCAPHQ15003 741 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 CLCA2Q9UQC9 943 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 RTN2O75298 545 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 APEX2Q9UBZ4 518 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 SPAG7O75391 227 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 CPT1AP50416 773 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 ST8SIA6P61647 398 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 RBP5P82980 135 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 MORF4L2Q15014 288 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 28.8
GAN-202ENST00000568107 STOX1Q6ZVD7 989 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 MS4A14Q96JA4 679 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 VCPKMTQ9H867 229 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 STYK1Q6J9G0 422 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 FAM47EQ6ZV65 393 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 DDIASQ8IXT1 998 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 LRRC71Q8N4P6 559 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 SLC35G2Q8TBE7 412 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 PHF20Q9BVI0 1012 aa8.5□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 NR1H3Q13133 447 aa8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 EFHBQ8N7U6 833 aa8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 AGR3Q8TD06 166 aa8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 TLR2O60603 784 aa8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 CD4P01730 458 aa8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 CCSER1Q9C0I3 900 aa8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 SLC38A7Q9NVC3 462 aa8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 ADA2Q9NZK5 511 aa8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 APRTP07741 180 aa8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 PRKCEQ02156 737 aa8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 TAF11Q15544 211 aa8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 CEP19Q96LK0 163 aa8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 AIPL1Q9NZN9 384 aa8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 FBXL5Q9UKA1 691 aa8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 ATP6V1E1P36543 226 aa8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 TKFCQ3LXA3 575 aa8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 GRID2IPA4D2P6 1211 aa8.49□□□□□ -1.05
GAN-202ENST00000568107 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.9 ms