RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568043.5

INO80E-212, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-212ENST00000568043 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20.21■□□□□ 0.83
INO80E-212ENST00000568043 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa20.21■□□□□ 0.83
INO80E-212ENST00000568043 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 CASTOR2A6NHX0 329 aa20.2■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 TBX3O15119 743 aa20.2■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 SPTLC1O15269 473 aa20.2■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 KIF4AO95239 1232 aa20.2■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
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INO80E-212ENST00000568043 FZD5Q13467 585 aa20.2■□□□□ 0.82
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INO80E-212ENST00000568043 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.2■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 TSSK4Q6SA08 328 aa20.2■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 TPH2Q8IWU9 490 aa20.2■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 TTPALQ9BTX7 342 aa20.2■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.2■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.2■□□□□ 0.82
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INO80E-212ENST00000568043 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
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INO80E-212ENST00000568043 LILRB5O75023 590 aa20.19■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 TARSP26639 723 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 HOXA9P31269 272 aa20.19■□□□□ 0.82
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INO80E-212ENST00000568043 TFDP1Q14186 410 aa20.19■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 NAB2Q15742 525 aa20.19■□□□□ 0.82
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INO80E-212ENST00000568043 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.19■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 MTSS1LQ765P7 747 aa20.19■□□□□ 0.82
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INO80E-212ENST00000568043 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.19■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 WASF1Q92558 559 aa20.19■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 CLDN23Q96B33 292 aa20.19■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa20.19■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
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INO80E-212ENST00000568043 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa20.19■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.19■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 A0A087WWV3 80 aa20.18■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 FAM205CA6NFA0 338 aa20.18■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 MARCH6O60337 910 aa20.18■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 SEC24BO95487 1268 aa20.18■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 TUSC3Q13454 348 aa20.18■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 LIN9Q5TKA1 542 aa20.18■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 HACE1Q8IYU2 909 aa20.18■□□□□ 0.82
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INO80E-212ENST00000568043 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.18■□□□□ 0.82
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INO80E-212ENST00000568043 ING5Q8WYH8 240 aa20.17■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 ZSCAN32Q9NX65 697 aa20.17■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
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INO80E-212ENST00000568043 KRT2P35908 639 aa20.16■□□□□ 0.82
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INO80E-212ENST00000568043 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.16■□□□□ 0.82
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INO80E-212ENST00000568043 SLFN12Q8IYM2 578 aa20.16■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 BORCS6Q96GS4 357 aa20.16■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.16■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 PARD6AQ9NPB6 346 aa20.16■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.16■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 COL4A2P08572 1712 aa20.16■□□□□ 0.82
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INO80E-212ENST00000568043 DCDC2BA2VCK2 349 aa20.15■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 POU2F2P09086 479 aa20.15■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 OR1D2P34982 312 aa20.15■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 RARRES1P49788 294 aa20.15■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 PFKPQ01813 784 aa20.15■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 ME3Q16798 604 aa20.15■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 ZNF687Q8N1G0 1237 aa20.15■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 PIGOQ8TEQ8 1089 aa20.15■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 TNFRSF25Q93038 417 aa20.15■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 GTF3C6Q969F1 213 aa20.15■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 HEBP1Q9NRV9 189 aa20.15■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.15■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 SNTG2Q9NY99 539 aa20.15■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 USP20Q9Y2K6 914 aa20.15■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 CHD8Q9HCK8 2581 aa20.15■□□□□ 0.82
INO80E-212ENST00000568043 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa20.14■□□□□ 0.81
INO80E-212ENST00000568043 XYLBO75191 536 aa20.14■□□□□ 0.81
INO80E-212ENST00000568043 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
INO80E-212ENST00000568043 LARGE1O95461 756 aa20.14■□□□□ 0.81
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