RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 HACE1Q8IYU2 909 aa20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 BADQ92934 168 aa20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 FAM212AQ96EL1 285 aa20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 ENPP3O14638 875 aa20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 RECQL4O94761 1208 aa20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 ITGA4P13612 1032 aa20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 AKAP5P24588 427 aa20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 YARSP54577 528 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 PSMD6Q15008 389 aa20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 USP37Q86T82 979 aa20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 TMC2Q8TDI7 906 aa20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 VPS16Q9H269 839 aa20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 RNF39Q9H2S5 420 aa20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 PARP2Q9UGN5 583 aa20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP20.8■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 LRRC10BA6NIK2 292 aa20.79■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 TPM2P07951 284 aa20.79■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 PFKMP08237 780 aa20.79■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 WNT7BP56706 349 aa20.79■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 DLG4P78352 724 aa20.79■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.79■□□□□ 0.922e-6■■■■□ 19.6
CTU2-204ENST00000564105 IKBKEQ14164 716 aa20.79■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 SURF1Q15526 300 aa20.79■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.79■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.79■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 LRCH3Q96II8 777 aa20.79■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 FNBP1Q96RU3 617 aa20.79■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 IL23AQ9NPF7 189 aa20.79■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 IL18RAPO95256 599 aa20.78■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 TRIM49P0CI25 452 aa20.78■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 TRIM49CP0CI26 452 aa20.78■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 FPGSQ05932 587 aa20.78■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.78■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 ENPEPQ07075 957 aa20.78■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 RNF169Q8NCN4 708 aa20.78■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 GBF1Q92538 1859 aa20.78■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 LPPQ93052 612 aa20.78■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 SLC35C1Q96A29 364 aa20.78■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 PGBD4Q96DM1 585 aa20.78■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 TTC26A0AVF1 554 aa20.77■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 LACTBL1A8MY62 500 aa20.77■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 ACRP10323 421 aa20.77■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 UBASH3AP57075 661 aa20.77■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 FAM189BP81408 668 aa20.77■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 KCNH2Q12809 1159 aa20.77■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 FILIP1LQ4L180 1135 aa20.77■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 MIIPQ5JXC2 388 aa20.77■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 SNX27Q96L92 541 aa20.77■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 ASB7Q9H672 318 aa20.77■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.77■□□□□ 0.92
CTU2-204ENST00000564105 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 AP5Z1O43299 807 aa20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 EOMESO95936 686 aa20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 TNNI1P19237 187 aa20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 MRE11P49959 708 aa20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 VWA3BQ502W6 1294 aa20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 SARM1Q6SZW1 724 aa20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 AGMOQ6ZNB7 445 aa20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 CD302Q8IX05 232 aa20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 CGRRF1Q99675 332 aa20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 NDST4Q9H3R1 872 aa20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 KLK14Q9P0G3 267 aa20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 IFNKQ9P0W0 207 aa20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 AFPP02771 609 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 TRIM5Q9C035 493 aa20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 GIT1Q9Y2X7 761 aa20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 KIAA1671Q9BY89 1806 aa20.76■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 A0A1B0GTH6 734 aa20.75■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.75■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 STX10O60499 249 aa20.75■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 ACTN1P12814 892 aa20.75■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 CLDN10P78369 228 aa20.75■□□□□ 0.91
CTU2-204ENST00000564105 JADE1Q6IE81 842 aa20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms