RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	MYL10	Q9BUA6	226 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	POFUT1	Q9H488	388 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	MTG2	Q9H4K7	406 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF69	Q9UC07	566 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFA10	O95299	355 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	F2	P00734	622 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	CPE	P16870	476 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	MAN1A1	P33908	653 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	MPL	P40238	635 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	KIR2DL3	P43628	341 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	DSG1	Q02413	1049 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	ADCY1	Q08828	1119 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	MPP3	Q13368	585 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP100	Q494V2	611 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF18B	Q86Y91	864 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF384	Q8TF68	577 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	MTFR1L	Q9H019	292 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	NCDN	Q9UBB6	729 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	MAST3	O60307	1309 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	TGM5	O43548	720 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	PROP1	O75360	226 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	GAA	P10253	952 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	CD53	P19397	219 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	BDNF	P23560	247 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	FLT3	P36888	993 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	NEK2	P51955	445 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC32	Q14392	662 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF180	Q86T96	592 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	CHPF	Q8IZ52	775 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	NXPE1	Q8N323	547 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	C7orf31	Q8N865	590 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC8	Q8TAM2	541 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	TOMM22	Q9NS69	142 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	SHTN1	A0MZ66	631 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	DIRC3	C9JPN6	131 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	DAPK3	O43293	454 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	PDE8A	O60658	829 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	KPNA6	O60684	536 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	RFPL1	O75677	317 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	SCGB1D2	O95969	90 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	CFB	P00751	764 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	PTMS	P20962	102 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	DOK3	Q7L591	496 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM83A	Q86UY5	434 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	EFHB	Q8N7U6	833 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	GPATCH11	Q8N954	259 aa		3.53	□□□□□ -1.84

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