RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557172.5

KLC1-223, Transcript of kinesin light chain 1, human

TSL 4

Gene KLC1, Length 540 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KLC1-223	ENST00000557172	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	SCLY	Q96I15	445 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	ASB7	Q9H672	318 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	RGS18	Q9NS28	235 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	SNTG2	Q9NY99	539 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	LACTBL1	A8MY62	500 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	ENPP3	O14638	875 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TEX33	O43247	280 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	MGEA5	O60502	916 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	ITGA4	P13612	1032 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TNNI1	P19237	187 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	DLG4	P78352	724 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	CLDN10	P78369	228 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	CETN1	Q12798	172 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	MFSD5	Q6N075	450 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TMEM192	Q8IY95	271 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TMEM199	Q8N511	208 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	PGBD4	Q96DM1	585 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	PARP2	Q9UGN5	583 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	IPP	Q9Y573	584 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TTC26	A0AVF1	554 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	PMM2	O15305	246 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	P4HA2	O15460	535 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	EOMES	O95936	686 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TRIM49	P0CI25	452 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TRIM49C	P0CI26	452 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	CXCL8	P10145	99 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	AKAP5	P24588	427 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	GCLM	P48507	274 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	FMO5	P49326	533 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	PPP3CA	Q08209	521 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	KRT39	Q6A163	491 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	WDR49	Q8IV35	697 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	DRC7	Q8IY82	874 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF516	Q92618	1163 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	CGRRF1	Q99675	332 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	APOL6	Q9BWW8	343 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	INTS13	Q9NVM9	706 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	HES2	Q9Y543	173 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	KAT6A	Q92794	2004 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172		A0A1W2PQC6	194 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172		C9IYK1	514 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	RECQL4	O94761	1208 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	KCNE1	P15382	129 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	ITGB8	P26012	769 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	CDC25B	P30305	580 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	WNT7B	P56706	349 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	IKBKE	Q14164	716 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	XKR4	Q5GH76	650 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	GBP6	Q6ZN66	633 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	SV2A	Q7L0J3	742 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	DERA	Q9Y315	318 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	C2CD2	Q9Y426	696 aa		10.59	□□□□□ -0.71
KLC1-223	ENST00000557172	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		10.58	□□□□□ -0.72
KLC1-223	ENST00000557172	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		10.58	□□□□□ -0.72
KLC1-223	ENST00000557172	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72

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