RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 SNX21Q969T3 373 aa20.18■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.18■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 POMKQ9H5K3 350 aa20.18■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 SFXN1Q9H9B4 322 aa20.18■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 C11orf16Q9NQ32 467 aa20.18■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.18■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 CHST7Q9NS84 486 aa20.18■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.18■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 GLUD1P00367 558 aa20.17■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 PROZP22891 400 aa20.17■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 NAB2Q15742 525 aa20.17■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 TMC5Q6UXY8 1006 aa20.17■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 BICD1Q96G01 975 aa20.17■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 EPSTI1Q96J88 318 aa20.17■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.17■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 RXFP1Q9HBX9 757 aa20.17■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 MAN1C1Q9NR34 630 aa20.17■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.17■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 NR2E1Q9Y466 385 aa20.17■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 TXLNAP40222 546 aa20.16■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 NCKAP1LP55160 1127 aa20.16■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 ATAT1Q5SQI0 421 aa20.16■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.16■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa20.16■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 USP49Q70CQ1 688 aa20.16■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 CEP57Q86XR8 500 aa20.16■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.16■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 MYCT1Q8N699 235 aa20.16■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 CLIC6Q96NY7 704 aa20.16■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 ACAP3Q96P50 834 aa20.16■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 USP28Q96RU2 1077 aa20.16■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 PARVGQ9HBI0 331 aa20.16■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 K7ENM7 598 aa20.15■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 ABLIM1O14639 778 aa20.15■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 TOM1L1O75674 476 aa20.15■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 BRD1O95696 1058 aa20.15■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 MYBP10242 640 aa20.15■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 CREMQ03060 361 aa20.15■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 ZPBP2Q6X784 338 aa20.15■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.15■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 SNX27Q96L92 541 aa20.15■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 TTPALQ9BTX7 342 aa20.15■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.15■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 DPP7Q9UHL4 492 aa20.15■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa20.15■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 PLXNA3P51805 1871 aa20.15■□□□□ 0.82
NEDD1-208ENST00000555806 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.14■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 DDIT3P35638 169 aa20.14■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 CLCNKBP51801 687 aa20.14■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 RTP2Q5QGT7 225 aa20.14■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 PALB2Q86YC2 1186 aa20.14■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 GPR65Q8IYL9 337 aa20.14■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 UROC1Q96N76 676 aa20.14■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 SLC38A7Q9NVC3 462 aa20.14■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 TRIP11Q15643 1979 aa20.14■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 PRR33A8MZF0 331 aa20.13■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 CLDN3O15551 220 aa20.13■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 TRAK2O60296 914 aa20.13■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 B3GAT3O94766 335 aa20.13■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 SPATA31D3P0C874 917 aa20.13■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 LIG4P49917 911 aa20.13■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF131P52739 623 aa20.13■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 STK38Q15208 465 aa20.13■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 SEZ6Q53EL9 994 aa20.13■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.13■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa20.13■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.13■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa20.13■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 GPR149Q86SP6 731 aa20.13■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 FNIP2Q9P278 1114 aa20.13■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 STK17AQ9UEE5 414 aa20.13■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 C2CD4DB7Z1M9 353 aa20.12■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa20.12■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 MCL1Q07820 350 aa20.12■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 SLC39A14Q15043 492 aa20.12■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 PSMD5Q16401 504 aa20.12■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 XKR4Q5GH76 650 aa20.12■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 FEZF2Q8TBJ5 459 aa20.12■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.12■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
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