RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	MTMR9	Q96QG7	549 aa		15.32	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	GAD1	Q99259	594 aa		15.32	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		15.32	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	APOL6	Q9BWW8	343 aa		15.32	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	DISC1	Q9NRI5	854 aa		15.32	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		15.32	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		15.32	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	15.32	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	GAS7	O60861	476 aa		15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	SPINK2	P20155	84 aa		15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	MLH1	P40692	756 aa		15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	SATB1	Q01826	763 aa		15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	PRKCQ	Q04759	706 aa		15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	CALCRL	Q16602	461 aa		15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	HASPIN	Q8TF76	798 aa		15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	CHST7	Q9NS84	486 aa		15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		15.31	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		15.3	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	PAPLN	O95428	1278 aa		15.3	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	15.3	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	15.3	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	F13A1	P00488	732 aa		15.3	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	FNTB	P49356	437 aa		15.3	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	GAS6	Q14393	721 aa		15.3	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	GRM2	Q14416	872 aa		15.3	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	RTP2	Q5QGT7	225 aa		15.3	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		15.3	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		15.3	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	FAM167A	Q96KS9	214 aa		15.3	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		15.3	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		15.3	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		15.3	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		15.3	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	VAV3	Q9UKW4	847 aa		15.3	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		15.3	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	WDR81	Q562E7	1941 aa		15.29	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		15.29	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	ARL5C	A6NH57	179 aa		15.29	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	MARCH6	O60337	910 aa		15.29	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	PTGDR	Q13258	359 aa		15.29	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	PPP2R5C	Q13362	524 aa		15.29	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	ACAP1	Q15027	740 aa		15.29	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	15.29	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		15.29	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		15.29	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	FUT10	Q6P4F1	479 aa		15.29	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		15.29	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		15.29	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	PGBD4	Q96DM1	585 aa		15.29	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	CPB2	Q96IY4	423 aa		15.29	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		15.29	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		15.29	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		15.29	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	WDR64	B1ANS9	1081 aa		15.28	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	15.28	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	RET	P07949	1114 aa		15.28	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	OR52Z1	P0C646	297 aa		15.28	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		15.28	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	SKI	P12755	728 aa		15.28	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	RAB27A	P51159	221 aa		15.28	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	DSC1	Q08554	894 aa		15.28	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		15.28	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	15.28	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		15.28	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	15.28	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	TMEM143	Q96AN5	459 aa		15.28	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		15.28	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	15.28	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	KLK14	Q9P0G3	267 aa		15.28	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	15.28	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	RAB23	Q9ULC3	237 aa		15.28	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		15.28	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	IPP	Q9Y573	584 aa		15.28	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	NOTCH4	Q99466	2003 aa		15.27	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	ZZEF1	O43149	2961 aa		15.27	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		15.27	■□□□□ 0.04

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