RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	ID4	P47928	161 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	PSMD5	Q16401	504 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	PARM1	Q6UWI2	310 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	CEP57	Q86XR8	500 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	FOXQ1	Q9C009	403 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	N4BP3	O15049	544 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	CCL16	O15467	120 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	LRRN2	O75325	713 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	TH	P07101	528 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	C8A	P07357	584 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	ATP2B1	P20020	1258 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	GPC5	P78333	572 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	ANKRD1	Q15327	319 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	LIN9	Q5TKA1	542 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	PJA1	Q8NG27	643 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	CDH7	Q9ULB5	785 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LETMD1-231	ENST00000551931	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	PRKCB	P05771	671 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	LIG1	P18858	919 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	MCM7	P33993	719 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	ANAPC15	P60006	121 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	ST3GAL1	Q11201	340 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	ITFG1	Q8TB96	612 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	FGF13	Q92913	245 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	POLI	Q9UNA4	740 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	COL4A2	P08572	1712 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	ANK1	P16157	1881 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	F5	P12259	2224 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	ACKR2	O00590	384 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	SP9	P0CG40	484 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	HOXA9	P31269	272 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	STARD6	P59095	220 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	MAPK6	Q16659	721 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	PADI6	Q6TGC4	694 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	NACC1	Q96RE7	527 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	POLD4	Q9HCU8	107 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	GDA	Q9Y2T3	454 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	SPTBN2	O15020	2390 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	CYP11B2	P19099	503 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	FGFR3	P22607	806 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	RPA1	P27694	616 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	OR1D2	P34982	312 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	NAMPT	P43490	491 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	GUCY1B3	Q02153	619 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	RAB33A	Q14088	237 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	TRIM29	Q14134	588 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	MTRR	Q9UBK8	725 aa		13.87	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		13.86	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		13.86	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931		I3L4J1	428 aa		13.86	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	XYLB	O75191	536 aa		13.86	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	CLCNKB	P51801	687 aa		13.86	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	ECM1	Q16610	540 aa		13.86	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		13.86	□□□□□ -0.19
LETMD1-231	ENST00000551931	PDXDC1	Q6P996	788 aa		13.86	□□□□□ -0.19

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