RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551676.5

PPP1CC-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-208	ENST00000551676	KYAT1	Q16773	422 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	WDR49	Q8IV35	697 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	INHA	P05111	366 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	FER	P16591	822 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	SOX5	P35711	763 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	OSMR	Q99650	979 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	CLTA	P09496	248 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	KIF11	P52732	1056 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	CEP120	Q8N960	986 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	B4GALT4	O60513	344 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	VNN1	O95497	513 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	RNF180	Q86T96	592 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF263	O14978	683 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	CABYR	O75952	493 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	IL18RAP	O95256	599 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	STAG3L1	P0CL83	205 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	FGFR4	P22455	802 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	ANXA13	P27216	316 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	GRK4	P32298	578 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	ARID5A	Q03989	594 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	SNX17	Q15036	470 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	FAM84A	Q96KN4	292 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	NT5C1B	Q96P26	610 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	DEF6	Q9H4E7	631 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	GINS2	Q9Y248	185 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	GRIN2D	O15399	1336 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676		A0A0U1RQJ8	604 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	AKR1B10	O60218	316 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	HLA-DRA	P01903	254 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	AXL	P30530	894 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	ARHGAP25	P42331	645 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	LHX8	Q68G74	356 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	RPAIN	Q86UA6	219 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	PTK2	Q05397	1052 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	SPA17	Q15506	151 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	SERINC5	Q86VE9	423 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	TMEM192	Q8IY95	271 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	FAM81B	Q96LP2	452 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	GFPT2	O94808	682 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	CCDC172	P0C7W6	258 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	MFAP3	P55082	362 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	EVI5	O60447	810 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	OSTN	P61366	133 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	GCNT1	Q02742	428 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	BIRC3	Q13489	604 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	KAT5	Q92993	513 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PPP1CC-208	ENST00000551676	CXCL8	P10145	99 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PPP1CC-208	ENST00000551676	GRM5	P41594	1212 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PPP1CC-208	ENST00000551676	PIK3CA	P42336	1068 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PPP1CC-208	ENST00000551676	ACLY	P53396	1101 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PPP1CC-208	ENST00000551676	CYP27A1	Q02318	531 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PPP1CC-208	ENST00000551676	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
PPP1CC-208	ENST00000551676	SLC18A3	Q16572	532 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PPP1CC-208	ENST00000551676	NOTUM	Q6P988	496 aa		27.76	■■■□□ 2.03

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