RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 TUFT1Q9NNX1 390 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 C2CD2Q9Y426 696 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 FAM25EA8MYX2 175 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MED7O43513 233 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF3P17036 446 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ADORA1P30542 326 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 HMGCS2P54868 508 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PPIL2Q13356 520 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 RASA2Q15283 850 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CDH24Q86UP0 819 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SENP7Q9BQF6 1050 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MRIQ9BWK5 157 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TRPV5Q9NQA5 729 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 F13A1P00488 732 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CSF1RP07333 972 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 KRT3P12035 628 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CD19P15391 556 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 KCNA3P22001 575 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SMARCA1P28370 1054 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 AP3M2P53677 418 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 RUNDC3AQ59EK9 446 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CORO6Q6QEF8 472 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CHPFQ8IZ52 775 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 EFHBQ8N7U6 833 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 BEST2Q8NFU1 509 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 RDM1Q8NG50 284 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ZFAND2BQ8WV99 257 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 EPAS1Q99814 870 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 USP26Q9BXU7 913 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TXLNGQ9NUQ3 528 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SEPT3Q9UH03 358 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MYPNQ86TC9 1320 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SGTAO43765 313 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 BAIAP3O94812 1187 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ALADP13716 330 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TNFAIP3P21580 790 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 VASPP50552 380 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 AK2P54819 239 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PCGF5Q86SE9 256 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 GPBP1Q86WP2 473 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PJA1Q8NG27 643 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SLC22A8Q8TCC7 542 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D7Q9P0N9 293 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 FGAP02671 866 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 RAB15P59190 212 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CASP8Q14790 479 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DGKDQ16760 1214 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 KRT40Q6A162 431 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CYB5D1Q6P9G0 228 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DYDC2Q96IM9 177 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF302Q9NR11 478 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ST7Q9NRC1 585 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 NDE1Q9NXR1 346 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 BCAP29Q9UHQ4 241 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 UBR1Q8IWV7 1749 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GW55 424 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SYF2O95926 243 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 NNMTP40261 264 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 EFNA5P52803 228 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 VCPP55072 806 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MTMR1Q13613 665 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 OASLQ15646 514 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
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