RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 C2CD2LO14523 706 aa22.86■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 TRAK2O60296 914 aa22.86■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 NR1I2O75469 434 aa22.86■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 MCL1Q07820 350 aa22.86■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.86■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 SHC4Q6S5L8 630 aa22.86■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.86■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 SUSD6Q92537 303 aa22.86■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 DDX12PQ92771 950 aa22.86■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 SNX27Q96L92 541 aa22.86■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
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CS-222ENST00000550996 CHST7Q9NS84 486 aa22.86■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 STK39Q9UEW8 545 aa22.86■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 FAM50BQ9Y247 325 aa22.86■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.86■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 MYH11P35749 1972 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 H0YCG3 227 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 PIGRP01833 764 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 URODP06132 367 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 STAT6P42226 847 aa22.85■■□□□ 1.25
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CS-222ENST00000550996 E2F4Q16254 413 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 SFR1Q86XK3 245 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 GJD3Q8N144 294 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 PDILTQ8N807 584 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 CASP10Q92851 521 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 GLUD2P49448 558 aa22.84■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 GTF2BQ00403 316 aa22.84■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 KANK3Q6NY19 840 aa22.84■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.84■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 SV2BQ7L1I2 683 aa22.84■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 BICD1Q96G01 975 aa22.84■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 ACAP3Q96P50 834 aa22.84■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.84■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.84■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 TEX28O15482 410 aa22.83■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 CLDN3O15551 220 aa22.83■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 FAM189A1O60320 539 aa22.83■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 CUTAO60888 179 aa22.83■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 CLCN4P51793 760 aa22.83■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.83■■□□□ 1.25
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CS-222ENST00000550996 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.83■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.83■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.83■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 CNTN3Q9P232 1028 aa22.83■■□□□ 1.25
CS-222ENST00000550996 TRIOO75962 3097 aa22.82■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 TISP43B9A030 160 aa22.82■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 TADA2AO75478 443 aa22.82■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 PPP1R37O75864 691 aa22.82■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.82■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 KCNE1P15382 129 aa22.82■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 RTP2Q5QGT7 225 aa22.82■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.82■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 STRA6Q9BX79 667 aa22.82■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa22.82■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.82■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.241e-6■■■■■ 66.8
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CS-222ENST00000550996 CXCL8P10145 99 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 SCP2P22307 547 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 KLRC2P26717 231 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 TNFSF9P41273 254 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 LIG4P49917 911 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 CLCNKBP51801 687 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 UPP1Q16831 310 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 USP41Q3LFD5 358 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 STAMQ92783 540 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 A0A0B4J269 797 aa22.8■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.8■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CS-222ENST00000550996 KCNA1Q09470 495 aa22.8■■□□□ 1.24
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