RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548391.1

PRAMENP-203, Transcript of PRAME N-terminal-like, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene PRAMENP, Length 1,445 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMENP-203ENST00000548391 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAMENP-203ENST00000548391 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
PRAMENP-203ENST00000548391 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
PRAMENP-203ENST00000548391 USTQ9Y2C2 406 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAMENP-203ENST00000548391 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
PRAMENP-203ENST00000548391 ZNF318Q5VUA4 2279 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 TGM5O43548 720 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 SPATA31D3P0C874 917 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 MYBP10242 640 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 MAPTP10636 758 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 RPL17P18621 184 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 SYT1P21579 422 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 OSTNP61366 133 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 CREMQ03060 361 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 SIGLEC14Q08ET2 396 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 FAM171A1Q5VUB5 890 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 LILRA6Q6PI73 481 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 MPZL3Q6UWV2 235 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 ZBTB33Q86T24 672 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 PALB2Q86YC2 1186 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 HDAC7Q8WUI4 952 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 KCNN1Q92952 543 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 CALML4Q96GE6 196 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 TCHPQ9BT92 498 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 TTPALQ9BTX7 342 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 DPP7Q9UHL4 492 aa12.96□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 DENND4AQ7Z401 1863 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 VWA8A3KMH1 1905 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 TMEM221A6NGB7 291 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 M0R296 226 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 RFPL2O75678 378 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 B3GAT3O94766 335 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 PAPLNO95428 1278 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 MCF2P10911 925 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 PLCG1P19174 1290 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 CLCNKBP51801 687 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 YARSP54577 528 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 STRN3Q13033 797 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 KARSQ15046 597 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 PTPAQ15257 358 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 UPP1Q16831 310 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 CD300LGQ6UXG3 332 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 CEP57Q86XR8 500 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 GLYCTKQ8IVS8 523 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 PIK3R5Q8WYR1 880 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 ASIC4Q96FT7 647 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 MFSD14AQ96MC6 490 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 ACAP3Q96P50 834 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 CLSTN3Q9BQT9 956 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 REEP2Q9BRK0 252 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 ODF2LQ9ULJ1 636 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 CLIC4Q9Y696 253 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 CITO14578 2027 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 TOM1L1O75674 476 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 PLA2G5P39877 138 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 NCKAP1LP55160 1127 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 RESTQ13127 1097 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 MCM6Q14566 821 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 FAM173BQ6P4H8 233 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 CYP26C1Q6V0L0 522 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 ZPBP2Q6X784 338 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 CCDC149Q6ZUS6 474 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 GPBP1Q86WP2 473 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 PLCD3Q8N3E9 789 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 KREMEN2Q8NCW0 462 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 RAD54LQ92698 747 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 PBXIP1Q96AQ6 731 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 SNX27Q96L92 541 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 UROC1Q96N76 676 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 CCSER1Q9C0I3 900 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 CNTN3Q9P232 1028 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 LIMD1Q9UGP4 676 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAMENP-203ENST00000548391 SORCS3Q9UPU3 1222 aa12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms