RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 TBC1D10CQ8IV04 446 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ZNF384Q8TF68 577 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ANKRD2Q9GZV1 360 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 INCENPQ9NQS7 918 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ZNF536O15090 1300 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ZNF831Q5JPB2 1677 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 EFCAB14O75071 495 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 MBD4O95243 580 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 CRTAMO95727 393 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 SERPINB2P05120 415 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 FDPSP14324 419 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ZNF28P17035 718 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 NCLP19338 710 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 GPR85P60893 370 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 GUCY1A3Q02108 690 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 RESTQ13127 1097 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 GRAPQ13588 217 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 TXNRD1Q16881 649 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 CAVIN4Q5BKX8 364 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 LBX2Q6XYB7 198 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ADGRA1Q86SQ6 560 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 LCORLQ8N3X6 602 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 NCOA7Q8NI08 942 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ZMYM6O95789 1325 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 WDR19Q8NEZ3 1342 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 AQP7O14520 342 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 RASGRP1O95267 797 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 APPP05067 770 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 GNAT2P19087 354 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 PDCP20941 246 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 MCM5P33992 734 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 MRE11P49959 708 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 DDR1Q08345 913 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 LSAMPQ13449 338 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 CRY2Q49AN0 593 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 FAM173BQ6P4H8 233 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 BRAPQ7Z569 592 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 FAM124AQ86V42 546 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 CHST13Q8NET6 341 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 MBD6Q96DN6 1003 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 SCLYQ96I15 445 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 SALL1Q9NSC2 1324 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 NUP98P52948 1817 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 C9orf118A6NHY6 69 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 SMIM22K7EJ46 135 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 PLSCR1O15162 318 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 RFPL3O75679 317 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 MBD3O95983 291 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 NKX3-2P78367 333 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 GPSM2P81274 684 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 CDSNQ15517 529 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.28□□□□□ -1.4
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